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野生山茶（CamelliajaponicaL.）具有重要的园林应用价值和生态价值，是培育众多茶花新品种的优良母本。目前，野生山茶的数量和分布范围正急剧减少，急需对野生山茶资源的现状和遗传多样性进行研究，以制定科学的保护措施。本研究对岛屿野生山茶的资源现状及生境条件进行了调查，并利用ISSR分子标记方法对山茶天然居群的遗传结构进行了分析。主要结论如下：1、野生山茶主要分布在华东沿海地区以及日本和朝鲜半岛的南部，南至浙江省玉环县（28°N），北达山东省青岛市（36N），西至我国东部沿海地区，东抵日本四国岛，分布范围广，分布海拔在0～1500m。舟山群岛是我国野生山茶的分布中心，分布数量在30万株以上。象山县也有野生山茶分布，但该地山茶遭破坏严重，数量很少。青岛市的长门岩岛分布有许多耐冬山茶大树，少幼树。日本南部多个岛屿也有成片的天然山茶林分布，生长状况良好。2、对我国部分地区山茶古树资源进行了调查，同时也对川渝地区的山茶古树进行了亲缘关系分析。调查结果表明我国山茶古树资源丰富，长江以南多个省市都保有山茶古树，但部分地区的古树资源正遭受人为或自然因素破坏，急需采取相应措施加以保护。3、采用ISSR分子标记，对东亚沿海地区13个山茶居群的遗传多样性进行分析。20个有效引物共扩增出清晰谱带211条，其中190条具多态性，总的多态性位点百分比（PPL）为90.05%。物种水平的有效等位基因数（Ne）为1.6052，Nei’s基因多样性指数（HT）为0.3414，Shannon信息多态性指数（Hsp）为0.5013，表明山茶物种水平遗传多样性较高。不同居群间的遗传多样性差异较大，PPL在66.35%～77.25%，Nei’s基因多样性指数在0.2344～0.2966，Shannon信息多态性指数在0.3478～0.4319，日本居群的遗传多样性较高。居群间遗传分化系数Gst=0.2127，基因流值为0.9255；岛屿地理距离与遗传距离之间存在显著相关性（r=0.8154，P<0.05），表明岛屿地理隔离应是导致山茶居群间遗传分化的重要原因。UPGMA聚类分析显示，青岛3个居群间亲缘关系很近，表明植物园居群和五四广场居群可能移植自长门岩岛。