近年来，随着人类基因组计划的发展，人们逐渐认识到不同个体对同一药物的不同反应，大多是源于基因的差异。由此人们在药物遗传学的基础上发展形成了药物基因组学，在分子和基因水平上研究揭示个体对药物不同反应的机理，这为患者或特定人群寻找合适的药物及适宜的用药方法开辟了新的前景。然而，在对药物基因组学技术的发展前景做期望的同时，这项新技术的应用还是不可避免的给人们带来了诸多伦理上的困惑。本文将通过对药物基因组学临床应用情况的分析，探讨医学共同体和伦理学共同体分别是如何看待药物基因组学应用带来的伦理问题，以及围绕这些伦理问题引发的广泛争论。本文将以老年痴呆症和乳腺癌的临床诊疗作为主要讨论对象，以希望能探讨出根植于临床实践的相应伦理准则。全文主要分为三个部分：第一部分，将在介绍药物基因组学及其临床应用的基础上，阐述当前药物基因组学的临床检测技术所面临的众多伦理挑战，并进一步介绍临床实际案例老年痴呆症和乳腺癌涉及的伦理问题。第二部分，以临床案例为基础，分别从知情同意、基因隐私和保密以及临床医疗决策三个方面，分析临床医务人员和伦理学家是分别从什么样的角度去看待这些伦理问题的，同时将从以上三个方面试图分析目前临床实践和现代生物伦理准则存在的利益冲突。第三部分，进一步探讨当前临床实践与生物伦理准则存在的冲突，指出临床医务人员实际面临的伦理问题与伦理学家所讨论的伦理问题在问题种类和问题所指等方面普遍存在一定的差距，即生物伦理准则与临床实际问题在一定程度上是脱节的。这些差距和脱节主要是由于大多数的生物伦理论证剥去了伦理讨论的特定案例所处的实际环境和背景情况。因此，具体的生物技术伦理问题仅在这些技术已被实际应用的背景环境中讨论才有实际意义，并由此建立新的生物伦理规范。