修饰基因对地中海贫血血液学表型影响的研究

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目的:本研究立足福建地区地贫样本和相关检验数据,选取具有代表性的地贫修饰基因进行人群的筛查,比较多个位点效应及其对血液学表型的影响,并对部分位点的进行功能探讨,以期为地贫的诊断和治疗提供新的思路。方法:1.对福建地区463例α和β地中海贫血个体及对照组人群采用多重PCR复合琼脂糖凝胶电泳法和PCR-RBD法检测α、β地贫基因;同时对样本行血常规、血红蛋白电泳、铁代谢等检测,收集各血液学表型参数。按地贫基因型以及HbF水平是否>1.5%将样本分为A-G共7组。采用Sanger测序法,检测所收集各组样本的KLF1基因。2.经HaploView 4.2筛选并采用高分辨率熔解曲线(HRM)法,检测HBG1、HBG2、HBS1L-MYB、BCL11A基因上的标签多态性位点,综合分析诸位点之间与地贫患者血液学表型参数之间的相关情况。3.用靶启动子的特定片段替换报告基因质粒(pGL3-basic)的启动子区,构建突变型和正常型重组质粒,将构建的质粒转染目的细胞,进行启动子荧光素酶检测。结果:1.共收集α、β地贫基因患者或携带者371例,分析发现福建地区地贫基因型分布有其特点。检出rs3817621,rs 2072597,rs 2072596,rs117351327,c.519-525dupCGGCGCC,c.895C>G,c.472G>A和c.1001C>G等KLF1基因变异位点。其中,rs3817621与rs 2072597和rs117351327存在连锁不平衡。KLF1变异的部分中间型地贫患者的HbF水平有别于野生型样本。HbA2、MCV、MCH等各项血液学参数暂未见差异。2.β地中海贫血患者的HBS1L-MYB基因中的rs4895441和KLF1基因中的rs3817621,均与HbF的水平相关。未检测到β地中海贫血患者的HBG1基因中的rs368698783、HBG2基因中的rs7482144、HBS1L-MYB基因中的rs28384513和BCL11A基因中的rs4671393,与HbF水平存在相关性。HBG1基因中的rs368698783与HBG2基因中的rs7482144存在连锁不平衡;HBS1L-MYB基因中的rs28384513与rs4895441连锁不平衡程度弱。3.转染情况良好,双荧光素酶报告基因体系构建成功。c.-251C>G变异的实验组较野生型对照组荧光强度降低,荧光素酶活性降低。结论:1.KLF1变异对不同程度地贫患者血液学表型有影响。该基因变异情况有别于其他地区。2.修饰基因多态性位点变异可影响地贫患者血液学表型中HbF水平变化。在地贫诊断中,筛查相关修饰基因上的多态性位点变异或可有助于疑难病例鉴别。3.c.-251C>G与KLF1启动子活性降低有关,其对应的SNP不应当被认作中性变异。
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