于2007年12月、2008年4月、2008年7月、2008年10月对赤潮高发区的珠江口和大亚湾海域进行环境背景调查,分析了珠江口和大亚湾海域的水文要素、营养盐、浮游植物的种类组成、丰度和优势种的时空分布特征,确定了影响浮游植物群落分布的关键环境因子,并对大亚湾和珠江口海域的环境因子进行了对比分析。此外,对1980—2007年广东沿海赤潮灾害历史资料进行统计分析,研究赤潮灾害的时空分布规律和赤潮肇事种的变化规律。结果表明:(1)珠江口海域的水温、盐度、溶解氧、pn范围分别为20.12-27.56℃,3.52-33.20,1.64-8.32mg/L和7.6-8.34。2008年7月,表底层盐度与pH有显著性差异。溶解无机氮、硝酸盐、磷酸盐2008年7月和10月含量高,2008年4月和2007年12月含量低。2008年4月硅酸盐含量最高,其含量都远远高于其余三次调查的结果(P＜0.01)。共鉴定浮游植物178种及变种。硅藻是珠江口海域的主要类群,占浮游植物总种数的65%。浮游植物数量的高峰出现在2008年10月,远远高于其余三个航次(P＜0.01)。2007年12月则以旋链角毛藻占绝对优势,而2008年4月和10月,中肋骨条藻几乎是珠江口海域所有站位的优势种。影响浮游植物群落的关键环境因子因时间的不同而有所不同,相关分析结果表明温度、盐度、亚硝酸盐和硝酸盐与浮游植物生物量没有显著的相关关系。(2)大亚湾海域的水温范围为20.34-28.24℃,盐度范围为20.37-34.79,溶解氧范围为0.23-7.17,pH范围为7.90-8.37。2008年7月,表底层水温、盐度、溶解氧和pH都具有显著性差异,特别是在湾口B9和B10站位,底层水体具有低温(＜24℃)、高盐(＞34)、低溶解氧(＜3mg/L),低pH的特征。共鉴定大亚湾海域浮游植物128种及变种,硅藻是主要的优势类群,占总种数的70.3%;2008年4月和10月,浮游植物的优势种类较为单一,旋链角毛藻、拟菱形藻和中肋骨条藻分别是最为明显的优势种类,尤其是2008年10月的拟菱形藻,其细胞密度多在10~6cells/L以上,在浮游植物中占有比例最高,达到88.18%。除了2008年7月,浮游植物细胞密度的高值区均位于澳头海域,低值区均位于大鹏澳核电站附近。2008年10月是浮游植物数量的高峰期,个别站位生物量达到10~7远远高于2007年12月,2008年4月和10月的浮游植物细胞密度。影响浮游植物群落的关键环境因子因时间的不同而有所不同,相关分析结果表明温度、溶解氧、氮、磷与浮游植物生物量没有显著的相关关系。(3)通过显著性分析,发现大亚湾与珠江口海域的浮游植物生物量没有显著性差异(P＞0.05)。大亚湾溶解氧无机氮、硝酸盐、亚硝酸盐显著低于珠江口,盐度显著高于珠江口。(4)广东沿海赤潮灾害的特征为:赤潮灾害总体呈上升趋势,发生频率不断增加;赤潮高发季节由过去的春季扩展到春夏秋冬季;赤潮发生海域和影响范围不断扩大;鱼毒性藻和有毒藻种类越来越频繁地引发赤潮;引发赤潮灾害的生物种类不断增多,由甲藻和硅藻引发的赤潮减少,而由针胞藻类、定鞭藻类和纤毛虫类引发的赤潮明显增多。