荷斯坦牛4个免疫基因SNPs与体细胞评分和泌乳性能的关系

来源 :扬州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gdw2009
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乳房炎是一种奶牛常发病、多发病,是奶牛养殖业危害最大、花费最高的疾病之一。除改善母牛营养、加强环境卫生管理和改进挤奶技术外,研究者正努力通过筛选乳房炎抗性候选基因的方法来有效控制乳房炎的发生。本研究以海丰奶牛场573头荷斯坦牛为试验材料,采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)、直接测序法及时间飞行质谱法分析IL8、CXCR1、IL12R和IL23R四个基因共6个SNPs位点的遗传多态性,采用最小二乘模型分析这4个基因6个突变位点与测定日产奶量、乳脂率、乳蛋白率和体细胞评分4个性状的相关性,寻找可用于生产实际的分子标记。主要研究结果如下:1.IL8基因3’侧翼区2862(T/C)位点与2988(A/G)位点为完全连锁突变位点,所以试验中仅对2862(T/C)位点进行分析。IL8基因3’侧翼区2862位点发生T→C的突变,定义了TT、TC和CC3种基因型,基因型频率分别为0.210、0.471和0.319,等位基因T和C的频率分别为0.446和0.554。IL8基因3’侧翼区2862(T/C)突变位点对蛋白率及体细胞评分的影响达到显著水平(P<0.05)。CC基因型奶牛的蛋白率和SCS都显著高于CT基因型个体(P<0.05)。2. CXCR1基因5’侧翼区-1830位点发生了A→G的突变,定义了3种基因型,即AA、 AG和GG,频率分别为0.681、0.291和0.028,等位基因A和G的频率分别为0.826和0.174。CXCR1基因5’侧翼区-1830(A>G)位点对日产奶量、SCS的影响达到显著水平(P<0.05)。AG基因型奶牛的日产奶量和SCS均显著高于AA基因型个体(P<0.05)。CXCR1基因编码区783位点发生了C→A的突变,检测到2种基因型,即AA和AC,基因型频率分别为0.895和0.105,等位基因A和C的频率分别为0.948和0.052。编码区783位点除了对SCS的影响不显著外(P>0.05),对其他3种泌乳性能的影响均达到显著水平(P<0.05)。AA基因型的日产奶量显著高于AC基因型个体(P<0.05),而其乳脂率、乳蛋白率却显著低于AC基因型个体(P<0.05)。3.IL12R β2基因5’侧翼区-246位点发生了G→T的突变,定义了3种基因型,即GG、 GT和TT,频率分别为0.916、0.082和0.002,等位基因G和T的频率分别为0.957和0.043。IL12R82基因5’侧翼区-246(G>T)位点对测定日产奶量和乳蛋白率的影响达到显著水平(P<0.05),而对乳脂率、SCS这两个性状的影响不显著(P>0.05)。GT基因型个体的日产奶量显著高于GG型个体(P<0.05),而其蛋白率却显著低于GG基因型个体(P<0.05),TT基因型个体的测定日产奶量和乳蛋白率均介于GT、TT基因型个体之间。4.IL23R基因5’侧翼区-856位点发生了A→G的突变,定义了3种基因型,即AA、 AG和GG,频率分别为0.564、0.400和0.036,等位基因A和G的频率分别为0.764和0.236。IL23R基因5’侧翼区-856(A>G)位点对以上4个性状的影响均不显著(P>0.05)。IL23R基因5’侧翼区-207位点发生了C→T的突变,定义了3种基因型,即CC、CT和TT,基因型频率分别为0.040、0.409和0.551,等位基因C和T的频率分别为0.245和0.755。与-856(A>G)位点一样,IL23R基因5’侧翼区-207(C/T)位点对以上4个性状的影响均不显著(P>0.05)。5.使用SHEsis软件对IL12R β2和IL23R两个基因3个位点进行单倍型分析,共得到6种单倍型,频率大小在0.001-0.750之间。选取3个位点均为纯合子的基因型,得到3种单倍型,其频率总和为0.978。方差分析表明:这3种单倍型对乳蛋白率的影响达到显著水平(P<0.05),而对另外3个性状的无显著影响(P>0.05)。
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