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植物内生菌及根际微生物产生的功能性代谢产物能为宿主植物提供一定的营养,还可提高宿主的抗病性和抗逆性。实验材料“川草2号”老芒麦、“川西”肃草、“阿坝”垂穗披碱草是3种优良新品种牧草。通过平板分离法,从3种牧草分离获得根际微生物和内生菌共173种,其中真菌22种、细菌151种。对各菌株进行抗小麦赤霉病和促进生长功能评价结果表明,4株真菌及61株细菌可产生吲哚乙酸（IAA）,浓度范围为0.02～14.75 mg/L,菌株PJ81产量最高为14.75 mg/L;有8株真菌和93株细菌可产生赤霉素（GA3）,浓度范围为11.03～468.91 mg/L,其中PJ119产量最高为468.91mg/L;9株真菌及85株细菌可产铁载体;有5株真菌和77株细菌能够降解纤维素。不同菌株抑制病原菌效果存在差异,抑菌率范围为:43.35%-82.76%。综合分析分离各菌株能力表明,菌株PJ22、PJ68、PJ73和PJ81均具上述的抗病和促生能力。真菌菌株中无同时具备促生及抗病能力的菌株,菌株PJ161在真菌中产生IAA能力最强,达8.76 mg/L,PJ112真菌产生GA3能力在真菌中最高,达285.55 mg/L。通过形态学和生理生化特性、16S rDNA进化分析和真菌的ITS序列进化分析表明,PJ22和PJ68属于芽孢杆菌属（Bacillus Cohn）,PJ73和PJ81属于丙酸杆菌属（Propionibacterium）,真菌PJ112和PJ161属于青霉属（Penicillium）。以根际菌株PJ81和PJ22组成复合菌剂Ⅰ,菌株PJ81、PJ22、PJ68、PJ73组成复合菌剂Ⅱ,内生菌PJ73和PJ68组成复合菌剂Ⅲ,内生真菌PJ112和PJ161组成复合菌剂Ⅳ。进行复合菌剂施用三种牧草盆栽实验结果发现,四种不同复合菌剂处理后,三种牧草的株高、叶长、叶宽、叶片颜色、叶片数、根长、主根长、主根数、侧根数及地上部分干重、根干重均有不同程度的增加。复合菌剂Ⅰ对三种牧草的促进作用最好,菌剂Ⅰ处理后的牧草叶片相比其它处理组更不易变黄;相比于对照组,菌剂Ⅰ对“川草2号”老芒麦、“川西”肃草、“阿坝”垂穗披碱草处理后的株高增加19.70 cm、21.12 cm、13.23 cm;叶长增加2.10 cm、9.40 cm、6.44 cm;叶宽增加了2.03 mm、1.39 mm、0.55 mm;叶片数增加2.33、0.67、0.00;主根数增加8.33根、8.83根、3.33根;侧根数增加了200根、110.83根、151.33根;主根长增加5.05 cm、4.38 cm、3.32 cm;根长增加9.20 cm、9.88cm、4.95 cm;地上部分干重增加130.90 mg、127.40 mg、96.10 mg;根干重增加27.50 mg、13.50 mg、24.20 mg。抑病效果评价结果表明,各复合菌剂均可降低牧草感病程度,且复合菌剂Ⅰ相比其它处理组穗抑病效果最好,对“川草2号”老芒麦穗、“川西”肃草的穗抑病率分别达到80%、90%。综合分析菌剂的促生抗病效果表明,菌剂Ⅰ（PJ81+PJ22）对于三种牧草的促生和抗病效果均有显著作用,且高于其它处理组。该菌剂可以作为牧草的促生菌剂和对小麦赤霉病病原菌的生防菌剂,为微生物菌剂用于治理退化草地提供了一定的基础,但对于复合菌剂在自然条件下对牧草的促生和抗病作用还有待于进一步研究。