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目的：探讨影响突触信号传导的 NRXN-NLGN-SHANK通路与儿童孤独症易感性的关系，为阐述孤独症的发病机制及实施干预治疗措施提供参考依据。 方法：采用病例对照的研究方法，纳入研究529名孤独症儿童和1923名湖北省健康对照人群，选取纳入 NRXN-NLGN-SHANK基因通路上的6个主要基因（NLGN1、NRXN1、NRXN2、NRXN3、PSD95、SHANK3）上10个功能性常见变异进行基因分型分析，通过拟合优度?2检验判断基因型分布是否符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律；用?2检验判断病例组和对照组等位基因和基因型频率分布情况。采用非条件logistic回归进行基因多态性与孤独症之间的关联性分析和基因-基因交互作用分析，采用SPSS13.0和Stata11.0软件运行。 结果： 1.研究共包括529名孤独症儿童（平均年龄为8.24±3.16岁），1923名健康对照人群（平均年龄为61.38±8.51岁）。病例组与对照组性别比例匹配，男性与女性比7:1。 2.非条件logistic回归分析的结果显示，NLGN1 rs9855544 A到G的突变和NRXN3 rs12879016 T到G的突变显著降低了孤独症的患病风险（OR=0.856,95%CI=0.746-0.981,P=0.025;OR=0.811,95%CI=0.699-0.941,P=0.006），NRXN2 rs12273892 A到T的突变显著增加了孤独症的患病风险（OR=1.328,95%CI=1.133-1.557, P＜0.001）；对性别进行分层分析，探讨整体分析中三个阳性位点NLGN1 rs9855544，NRXN2 rs12273892，NRXN3 rs12879016在不同性别间的影响，结果发现在男性中rs9855544 A到G的突变和rs12879016 T到G的突变也同样降低了孤独症的患病风险（OR=0.849,95%CI=0.732-0.985,P=0.030;OR=0.790,95%CI=0.671-0.930,P=0.005），rs12273892 A到T的突变显著增加了男性孤独症的患病风险（OR=1.347,95%CI=1.134-1.600,P=0.001），但是这种影响在女性患者中并未发现。 3.用 logistic回归模型评估 SNP-SNP之间潜在的相乘和相加交互作用。我们发现了rs9855544与rs12273892两位点的相乘交互作用接近统计学意义（P=0.066），分类的基因型相乘模型显示，与携带rs9855544GG基因型和rs12273892 AA基因型的个体相比，携带rs9855544 AA+GA基因型和rs12273892 AA基因型的个体患孤独症的风险增加了0.711倍(OR=1.711,95%CI=1.162-2.520）；携带rs9855544 GG基因型和rs12273892 TT+AT基因型的个体患孤独症的风险增加了1.507倍（OR=2.507,95%CI=1.553-4.047）；携带rs9855544AA+GA基因型和rs12273892 TT+AT基因型的个体患孤独症的风险增加了1.219倍（OR=2.219,95%CI=1.531-3.217）。其它位点之间的交互作用并未发现。 结论：影响突触信号传导的 NRXN-NLGN-SHANK基因通路上的 NLGN1 rs9855544，NRXN2 rs12273892，NRXN3 rs12879016位点的遗传变异与孤独症的发病风险显著相关，并且对男性的影响更明显。NLGN1 rs9855544和NRXN2 rs12273892两位点可能存在显著的相乘交互作用，同时携带两位点的危险基因型会对孤独症的发病风险产生更显著的影响。