枯草芽孢杆菌感受态基因调控回路中时滞驱动的动力学机制

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作为非致病性微生物,枯草芽孢杆菌在工业、农业、医药卫生、食品保健等方面都有应用价值.例如,在破伤风、炭疽等疫苗的研究中充当一类新型疫苗载体.有意思的是,枯草芽孢杆菌处于一种特殊生理状态感受态时,外界环境里的DNA分子可以进入细胞内参与遗传,正是这一特性使得它具有重要和广泛的应用价值.因此,越来越多的学者和专家开始关注枯草芽孢杆菌进入和退出感受态的基因调控网络或回路的构成以及动力学机制.大量的研究表明在基因表达过程中时滞不可避免,它的出现往往会引起系统动力学性质上的很大变化.然而,在枯草芽孢杆菌感受态基因调控回路中,时滞的调控作用却很少受到关注.因此,研究具有时滞的枯草芽孢杆菌感受态基因调控回路的动力学机制具有很大的现实意义.本文主要研究时滞、参数以及它们的组合对于枯草芽孢杆菌野生型基因调控回路和添加正反馈环的假设基因调控回路CircuitOne的影响.在前人建立的相应数学模型基础上,考虑了时滞项,分别从理论分析和数值模拟两方面来进行阐述.结果表明:首先,对于野生型基因调控回路,时滞具有诱发回路振荡的能力.但是,随着ComK基础表达率水平和ComK饱和表达率水平的提高,即正反馈强度的提高,相应的具有时滞的振荡系统变得稳定,这保证了枯草芽孢杆菌的感受态表型.其次,对于假设回路CircuitOne,时滞也具有引起核心因素振荡的作用.而且,模型中的一些参数也可以调节核心因素的动态行为.在添加时滞的调控后,参数的作用发生了显著的转换:动态特性发生变化或临界值发生变化,甚至直接消除了原本参数的作用.以上这些结果将有助于分析如何维持枯草芽孢杆菌的感受态,服务于枯草杆菌的有效利用.
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