D-塔格糖3-差向异构酶的研究——细菌筛选、酶分离纯化及克隆表达

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稀有糖是自然界存在极少的单糖及其衍生物的总称,具有独特的保健功能和潜在的医疗价值。D-塔格糖3-差向异构酶(D-tagatose3-epimerase,DTE,EC5.3.1.-)家族是稀有糖生物转化法制备的关键酶。本文以探索新的DTE家族为目标,分为菌种筛选、发酵条件优化、酶分离纯化及酶学性质和基因克隆表达及酶学性质4个步骤展开工作。主要结果如下:   1.筛选获得一株可产D-塔格糖3-差向异构酶的菌株SK011,通过形态观察、生化特性、16S rDNA序列比对,鉴定为类球红细菌(Rhodobacter sphaeroides,R.sphaeroides),定名为R.sphaeroides SK011;   2.R.sphaeroides SK011液体发酵生产DTE的最适培养基和发酵条件为:碳源为葡萄糖,浓度为1%,氮源为酵母膏和胰蛋白胨,浓度分别为2%和1.25%,氯化钠0.3%,二水磷酸二氢钠0.3%,硫酸镁0.05%,培养初始pH7.0;在发酵初始添加0.2%D-塔格糖作为诱导物;种龄24 h,装液量为20 mL/250 mL,接种量3%,30℃、180 rpm、避光,发酵时间36 h;   3.粗酶液经硫酸铵沉淀、DEAE-Sepharose CL6B Fast Flow离子交换色谱和Superdex75凝胶过滤等步骤,分离纯化得到DTE,比酶活提高26.8倍,达到13.4U/mg,经SDS-PAGE鉴定达到电泳纯,由2个相同的亚基组成,分子量为64 kD;   4.酶学性质测定结果显示,该酶最适作用温度40℃,最适pH值9.0,在40℃以下,pH8-10之间保持稳定;Mn2+对酶活力有促进作用,Cu2+、Zn2+对酶活力有不同程度的抑制作用;对D-塔格糖底物专一性最强;该酶N-端氨基酸残基序列依次为MKNPVGIISM,与目前已确定DTE家族均不一致,NCBI中仅检索得到与之具有相同N-端氨基酸残基的计算注明(Conceptual translation)序列:Rsph170293406,这是R.sphaeroides中首次发现的DTE家族,定名为R.sphaeroides DTE;   5.成功克隆Rsph170293406基因,插入表达载体pET-22b(+),转入表达宿主E.coliBL21(DE3),构建重组菌株E.coli BL21(DE3)(pET-dte),诱导表达得到具有DTE的功能的重组蛋白,在pH9.0和40℃条件下表现最大酶活,在40℃以下,pH8-10间保持稳定;Mn2+对酶活力有促进作用,Cu2+、Zn2+对酶活力有不同程度的抑制作用,以上酶学性质与野生型R.sphaeroides DTE一致,说明Rsph17029_3406基因在E.coli BL21(DE3)(pET-dte)表达系统中进行转录、翻译后折叠成为具有活性的R.sphaeroides DTE蛋白高级结构;确定Rsph17029_3406基因为R.sphaeroides DTE的编码基因,在GenBank数据库登记,基因登记号为FJ851309,对应蛋白质编号AC059490;   6.重组R.sphaeroides DTE对D-果糖底物专一性最强,其次为D-塔格糖,与野生型酶不同;   7.在pH9.0,40℃条件下测得D-可洛酮糖与D-果糖之间差向异构反应平衡常数为23∶77。
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