大物流工程项目类制造系统是指以工程项目为业务对象，原材料消耗量较大，原材料成本占总成本的很大比例，并且企业物流涉及面广，控制复杂的制造系统。研究大物流工程项目类制造系统及其资源优化配置技术，对于这类企业调整当前结构，优化系统运行和资源配置，实现制造过程的整体集成和可持续发展具有重要的作用。本文首先在分析工程项目类制造企业经营流程的基础上，提出了大物流工程项目类制造系统的概念， 指出了大物流工程项目类制造系统的物流、项目两大主线特征；在吸收和总结国内外物流、工程项目研究成果的基础上，建立了包括目标体系、资源体系、过程体系、内容体系和组织体系等五个组成部分的大物流工程项目类制造系统体系结构，揭示了它的内在联系与特性；在此基础上分析和建立了大物流工程项目类制造系统实施模式，其内容包括工程项目的分布式并行推进过程、工程项目集成管理与控制、物流系统异地制造加工的优化调度和管理模式。研究了大物流工程项目制造系统工作结构的分解（WBS），剖析项目资源计划系统体系结构等问题，提出了一套解决项目资源跟踪、控制和项目更改资源控制的方法。论文对大物流工程项目类制造系统中的多个综合资源优化配置问题进行了深入的研究：提出了多项目的多维物料的综合优化分配问题和求解方法；研究了工程项目分散组织结构下反应下层决策者自治权的资源配置问题，建立了相应的数学模型，提出了基于神经网络的的算法；分析了工程成本-进度问题,建立了工程项目成本与进度综合系统的数学模型；研究了劳动力资源需求及结构优化问题，进行了劳动力需求总量的测算，在此基础上进行了人力负荷曲线的绘制和优化分析。最后，利用上述的研究成果，开发了一套大物流工程项目管理及资源配置系统。本论文的研究内容是国家863/CIMS主题项目和目标产品的重要组成部分。并且以国家863/CIMS应用工程—— “深圳方大集团CIMS应用示范工程”（863-511-810-012-1）作为工程应用背景。本论文提出的理论、方法和开发的大物流工程项目管理及资源配置软件系统应用在方大公司的实际工程项目运作中，取得了较好的效益。