荔枝(Litchi chinensis Sonn.)是重要的热带亚热带果树之一。荔枝胚胎发育状况决定种子的大小,直接影响果实的食用和加工品质,还与荔枝产量有密切关系。因此,开展荔枝胚胎败育的机制研究不仅为培育良种荔枝提供理论支持,而且在生产上具有实际应用价值。本研究试图通过cDNA-AFLP技术和杂交方法分离和鉴定出荔枝胚胎发育相关的基因,为今后展开荔枝胚胎发育分子机制的研究和生产上制定调控措施提供依据。本试验以胚胎发育的正常型、部分败育型和完全败育型荔枝幼胚为材料,运用cDNA-AFLP技术对3个材料的cDNA进行了差异分析。筛选出60多对引物组合,构建了荔枝胚胎发育cDNA-AFLP图谱,通过对图谱多态性片段分析,从3000多条TDFs中,挑取了60条进行了回收、测序、同源性比对分析以及杂交验证。其中31条测序成功,经BLAST比对发现有7个TDFs序列信息与其它物种的胚胎发育相关基因有较高的同源性,分别是TDF1(F3H),TDF2(AP4.3A),TDF3(CCR4-NOT),TDF26(GRP23),TDF38(磷脂酶合成酶基因),TDF45(脂酰肌醇激酶基因),TDF55(酪蛋白激酶基因)。这些基因主要与胚胎发育过程信号转导、RNA干扰现象相关。杂交结果显示,TDF1在‘乌叶’、‘兰竹’中被检测到,而TDF38仅在‘兰竹’中被检测到,这与cDNA-AFLP图谱表现一致。因此,推测荔枝胚胎发育过程中存在信号转导调控和RNA干扰调控途径,如出现异常,会导致胚胎的中途败育。