创新型都市圈作为国家新型城镇化和创新驱动战略协同承载平台，其良好的建设是落实国家战略、跟随时代步伐的可行举措。然而在建设过程中，资源、环境问题日益凸显使得都市圈中传统产业发展模式面临着严峻的挑战。针对这个问题，“十三五”规划提出通过转变经济发展方式、优化升级传统产业、支持战略性新兴产业来调整优化产业结构，促使其向高端高效发展。有鉴于此，本文着重对长三角创新型都市圈的产业结构优化进行研究。　　首先，本文梳理了创新型都市圈和产业结构优化的理论知识，并对两者之间的关系进行深入分析，认为合理的产业结构能够促进创新型都市圈经济的增长和整体竞争力的提升，而创新型都市圈又以产业创新、产业升级和产业结构优化为基本特征，两者之间相互依赖，紧密联系。其次，结合长三角创新型都市圈传统产业结构现状分析的相关指标和高新技术产业现状分析的相关指标，构建出产业结构优化评价指标体系，借助主成分分析法对长三角创新型都市圈的产业结构优化水平进行综合评价，并推测未来技术创新对产业结构优化起重要的促进作用，最后借助时间序列模型加以验证。　　研究表明，目前长三角创新型都市圈产业结构的调整空间比较大，具体来说，长三角产业结构与就业结构不相协调、产业同构化严重、高新技术产业的科技活动投入与产出不协调等，所以本文认为长三角创新型都市圈应该加强三次产业协调、融合发展，以达到产业结构合理化;提高产业结构高度化水平，协调好与经济增长的同步性;加强“两省一市”产业之间专业化分工与合作;重视高新技术产业的发展，依靠技术创新提高产出水平;加快打造现代产业体系，实现新兴产业、传统产业优化发展。在新时期，促进长三角创新型都市圈向更好的方向发展。