脑干是人体内的生命中枢，脑干内有很多神经核团，对维持人体基本生命活动有重要的作用。脑干内部结构很复杂，脑干内神经核团的空间形态、空间位置和相互之间的毗邻关系，大部分没有被精确地、定量地描述过，所以脑干部位的疾病往往都很难以被治疗，被认为是手术禁区。在影像学技术的帮助下，立体定向手术越来越多的应用于脑干疾病。目前通过CT和MRI对人体组织及脑干重建较多，但是大部分脑干内神经核团都没有被重建过，由于受到CT和MRI扫描层厚和分辨率的限制，所提供的的信息对于很多临床疾病来说还是远远不够。但是组织学切片厚度相比CT和MRI小很多，也易于实现，所以基于组织学脑内神经核团的三维重建是很有必要的，目前基于组织学切片的脑干内神经核团三维重建却罕见。　　有鉴于当前的情况，我们提出了本文的研究。目的是精确定位脑干内各神经核团的位置形态及毗邻关系。目标是制作大数量（1000张以上）的脑干的连续图谱、取得脑干、下橄榄核的三维计算机模型及取得下橄榄核、薄束核和楔束核的三维数据。研究的结果可以为临床和教学提供数据参考。　　制作脑干图谱的实验标本是两例取自中国成年男性尸体的脑干，经比较各切片方法的优缺点，再结合本标本较陈旧的特点，选择石蜡切片方法制作切片。将脑干分段，按序号标记，脱水后制成石蜡块。然后对石蜡块切片，用焦油紫进行染色，染色后的切片进行照相。由于样本面积很大，采用分区照相、然后在图像处理过程中进行拼合成整切片图的方法，获取各切片的数字图像。最后共形成二个样本共1520张大薄样本切片图像，经精选构成一套连续的1000张断层图像的脑干图谱。　　脑干及脑干神经核团的三维重建研究以制成的大数量的大薄样本切片图谱为基础。先对获得图谱图像进行处理，将图像配准之后，采用自动分割和人工分割相结合的方法把全脑干、橄榄核、薄束核和楔束核分别分割出来。因本研究有获取数据和构建计算机模型两个方面的要求，故同时采取体重建和面重建两种方法进行三维重建。　　重建后，用三维测量软件对重建成的结构进行三维测量，获得这些结构的三维数据，通过三维演示软件，可对这些结构进行任意角度旋转观察，任意方位切割操作。　　由此，通过本研究得到以下结果:①获得了一套近1000张的连续的脑干图谱。②得到了脑干、下橄榄核、薄束核、楔束核的计算机三维模型。③取得了下橄榄核、薄束核、楔束核的三维位置和三维毗邻关系的数据。