大学跨学科研究组织协同创新是指大学跨学科研究组织紧密围绕科技、经济和社会发展中的重大需求,组织内部众多不同学科的参与者拥有共同目标,突破学科间的壁垒,促进机制体制创新,充分激活“人才、资本、信息、技术”等各种资源要素,开展深度合作,服务国家科技战略需求、解决社会重大问题,进行文化传承,促进知识生产、知识传播和知识转移,实现协同创新目标。随着“2011计划”的实施,大学跨学科研究组织要获得发展,应该积极主动,充分抓住国家政策机遇和发挥自身的跨学科研究优势,以学科交叉融合为导向优化资源配置方式,吸纳社会各类创新力量开展跨学科研究,构建“多元、融合、动态、持续”的协同创新体制机制。然而,当前我国大学跨学科研究组织协同创新的实践却面临重重困境。因此,本论文从协同创新的视角出发,借鉴协同学、知识三角理论观点,运用访谈研究、扎根理论、问卷调查等实证研究方法,对大学跨学科研究组织协同创新的影响因素进行识别。结合我国大学跨学科研究组织协同创新的现实困境,借鉴美国大学跨学科研究组织协同创新的经验,提出促进大学跨学科研究组织协同创新的管理策略和政策建议,有着重要的理论价值和实践意义。本论文的研究工作及其结果主要集中在以下几个方面：1.界定了大学跨学科研究组织协同创新的概念和内涵,分析了大学跨学科研究组织协同创新的优势,揭示了大学跨学科研究组织协同创新的功能与本质。2.通过访谈研究和运用扎根理论研究方法,对大学跨学科研究组织协同创新的影响因素进行了识别。通过问卷调查,提炼了大学跨学科研究组织协同创新面临的六种困境。3.分析了大学跨学科研究组织内部协同创新的动力因素,以及各动力因素之间相互依存、相互制约和相互影响的作用机理。在对影响大学跨学科研究组织协同创新的动力因素作用机理分析的基础上,提出大学跨学科研究组织协同创新的动力模型。4.选取了美国斯坦福大学Bio-X中心等三个具有代表性的美国大学跨学科研究组织,对这些大学跨学科研究组织协同创新的案例分析后并总结运行经验,为我国大学跨学科研究组织协同创新提供了很好的借鉴作用。5.基于上述理论分析与实证研究结果,本研究围绕大学跨学科研究组织协同创新面临的困境与驱动力,从协同目标、管理体制、运行机制、政策保障和文化融合方面提出了促进大学跨学科研究组织协同创新的管理策略,并对促进我国大学跨学科研究组织协同创新提出了积极的政策建议。