不同密度水凝胶支架中三维软骨细胞基因表达差异的转录组测序研究

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目的探究软骨细胞-海藻酸钠凝胶构建体中软骨细胞的转录组水平的变化。方法将软骨细胞分别封装在0.8%和4%海藻酸钠溶液制成的水凝胶中,制成细胞-凝胶构建体并培养一段时间。对两种凝胶材料的交联密度、溶胀率、模量等物理性能进行表征,然后通过RNA测序技术从这两种培养条件中检测到软骨细胞转录组的差异并进行比对和分析。最后,通过q PCR和免疫组织化学对测序结果进行验证。结果我们发现,与4%构建体相比,0.8%构建体具有较低的交联密度、较高的溶胀率以及较高的营养交换渗透性。通过RNA测序从这两种培养条件中检测到软骨细胞转录组的差异,发现差异表达基因(DEGs)反映在细胞外基质(ECM)分泌、细胞周期、细胞增殖、软骨发育等方面。值得注意的是,与软骨ECM和细胞增殖相关的DEGs的表达在0.8%构建体中上调,而参与细胞周期和基质降解的DEGs的表达在4%构建体中上调;在0.8%构建体中,软骨细胞肥大标志物的基因表达上调,而4%构建体似乎有利于软骨细胞表型的长期维持。此外,软骨细胞的转录组水平也受到构建体培养时间长短的显著影响。这些结果也通过了q PCR和免疫组织化学验证。结论在软骨组织工程中,不同密度的凝胶由于其不同的物理性质会为软骨细胞造就不同的微环境,引起的软骨细胞的转录组水平发生变化,这些变化体现在细胞增殖、基质分泌、细胞表型维持等方面。
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