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西瓜花叶病毒是侵染葫芦科的重要病毒之一，其在黄瓜上的流行受到人们的关注。传统的病毒检测方法受毒源、接种环境等限制，缺乏快速检测方法。近几年来，分子标记技术被应用于多方面。分子标记辅助育种技术，相对于传统育种，可以缩短育种周期，并且可从分子水平上找到抗病基因或与抗病相关的QTL位点。
本试验利用高代自交系“65G”（感病）和“228”（抗病）构建的六世代群体，对WMV进行了遗传规律的分析，并利用黄瓜基因组SSR引物对WMV的抗病基因wmv进行了定位。结果如下:
1.通过对以高代自交系“65G”和“228”构建的六世代群体进行WMV苗期鉴定，发现FI全感病，以65G回交的群体全感病，以228回交的群体一半感病、一半抗病，F2感病与抗病比为3∶1。试验表明，该遗传群体对WMV的抗性是由隐性单基因控制的。
2.根据前人研究结果和黄瓜基因组序列综合分析，挑选黄瓜6号染色体上的243对SSR引物，再结合BSA法进行分析，获得具有多态性的引物111对，引物多态性为45.7％。BSA建池筛选后，初步获得20对标记可能与wmv连锁，通过Joinmap4.0做连锁图，最终将wmv定位在黄瓜6号染色体上，wmv位于标记SSR17604和SSR17591之间，遗传距离分别为5.6cM和25.8cM。根据前人研究和本课题现有的标记在wmv初定位区间寻找并增加6个新标记后，wmv被进一步定位到SSR10449和SSR16005之间，遗传距离分别是2.9cM和0.3cM。
3.对SSR16005和SSR10449之间的序列进行分析，发现wmv定位区域的物理距离约为416.5Kb，定位区间有88个候选基因，其中5个与抗病基因相关。
4.利用获得的与wmv紧密连锁的3个侧翼标记SSR16005、SSR10449和UW016108对28个不同遗传背景的黄瓜材料进行验证，结果SSR16005的准确率为78.5％，SSR10449和UW016108的准确率均为89.3％。使用三个标记相互印证进行验证的准确率可达96.4％。