随着国家政治体制和经济体制改革的不断深入,农村基层组织人员管理农村公共事务并在一定范围代替政府行使国家机关的管理职能。特别是近年来自然灾害不断频发,农村基层组织人员协助人民政府管理救灾款物的事务也不断扩大,一些觉悟不高的村干部借机贪污、挪用救灾款物的实例越来越多。由于农村基层组织人员职务犯罪特殊主体以及客观行为的复杂性,使得司法实践中存在很大的争议。本文结合一起农村基层组织人员贪污救灾款的案例,分析了农村基层组织人员职务犯罪定罪过程中产生的争议。分析了农村基层组织人员职务犯罪司法界定的疑难,通过完善相关的立法来解决农村基层组织人员职务犯罪的司法界定疑难。第一部分：主要介绍了农村基层组织人员贪污救灾款案的案情以及审判结果,提出了审判过程中争议的焦点。第二部分：主要对农村基层组织人员贪污救灾款案的争议焦点做了法律分析,第一,对大学生村官王某特殊身份的认定；第二,对马某是否利用职务便利的分析；第三,对于不具有特殊主体身份的王某,利用马某的职务之便骗取、私分救灾款的行为构成共同贪污罪的分析。四,马某在未依法享有管理救灾款的权力之前与王某虚构事实、夸大受灾情况、骗取救灾款,其行为构成诈骗罪还是贪污罪。第三部分：通过对农村基层组织人员贪污救灾款案的分析,引发了农村基层组织人员职务犯罪的司法界定疑难,通过立法或者明确司法解释来解决农村基层组织人员职务犯罪的司法界定疑难问题。结语部分：主要概述了目前我国农村基层组织人员职务犯罪的现状,认为要想使农村基层组织中新出现人员的犯罪行为得到有效惩处,就应当使立法、司法实践和社会发展相适应。