基于线粒体基因组探讨中国麻蜥属的系统发生关系

来源 :杭州师范大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:jianlzho
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线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)具有母系遗传、分子量较小、进化速度快、无组织特异性、无重组等特点。近20年来,最为重要的分子标记之一就是线粒体基因的标记,它被广泛地应用在分子生态学的各个方面,在确定动物类群的系统地位和系统关系等方面起到了积极的作用(Boore and Brown,1998;Carapelli et al.,2007)。目前,测定分析线粒体基因组全序列并且将其作为分子标记己引起了分子系统学研究者极大的兴趣,并逐渐成为动物进化遗传学和分子遗传学研究的主要手段之一。通过测得中国麻蜥属6个种的线粒体基因全序列,结合NCBI数据库中已报导的丽斑麻蜥和山地麻蜥的线粒体基因组全序列,探讨中国麻蜥属8个物种之间的系统进化地位,为解决麻蜥属系统发生关系提供分子证据。  本研究主要内容包括:⑴测得的麻蜥属的6条线粒体基因组全序列分别为:虫纹麻蜥(19914bp),密点麻蜥(19385 bp),荒漠麻蜥(18225 bp),快步麻蜥(18033 bp),网纹麻蜥(16475 bp)和敏麻蜥(15238 bp)。其中虫纹麻蜥,密点麻蜥,快步麻蜥三个物种的线粒体基因组已经全部测得,快步麻蜥,网纹麻蜥和敏麻蜥测得除控制区以外的线粒体基因组。通过分析测得数据,得出这六个物种的线粒体基因组全序列和NCBI数据库中报道的丽斑麻蜥和山地麻蜥的排列顺序,基因组成和转录方向完全一致,包括1个主要的非编码控制区(D-loop控制区),1个轻链复制起始端(OL结构),2个核糖体基因(12S rRNA和16S rRNA),13个蛋白编码基因(ATP6,ATP8,COI-III,ND1-6,ND4L,Cytb),22个tRNA基因。⑵虫纹麻蜥,密点麻蜥,荒漠麻蜥,快步麻蜥,网纹麻蜥和敏麻蜥线粒体基因组成具有AT偏向性,它们的A+T含量分别为:59.8%,60.1%,58.2%,58.0%,58.0%,57.8%。⑶麻蜥属物种的蛋白编码基因中,ATA是使用最多的起始密码子,ATG次之;TAA是使用最多的终止密码子。⑷六种所测定的麻蜥属物种的tRNA基因,均可以折叠成典型的三叶草二级结构。此中,一般都存在着碱基错配的想象,大部分错配是U·G碱基之间的错配。⑸系统发育关系显示,分布于中国的麻蜥属物种是一个单系群,密点麻蜥和荒漠麻蜥的遗传距离特别小,丽斑麻蜥和山地麻蜥形成姐妹种。
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