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目的研究广西野生银星竹鼠寄生株马尔尼菲青霉菌(penicilliummarneffei,PM)和人感染株PM的基因型差异以及与致病相关性。方法采用氯化苄提取法或液氮研磨法提取基因组DNA。运用多位点微卫星标记分型法(MLMT)分别对40株临床分离PM和43株竹鼠分离PM菌株进行基因多态性及其相关性分析。结果(1)43只广西野生银星竹鼠自然携带PM阳性率100%。(2)微卫星标记多态性分析从83个样本在8对微卫星位点上共发现有86个等位基因,其中PMMⅠ的多态性最为丰富,拥有的等位基因数最多,共42个,PMMⅧ所拥有的等位基因最少,为8个,表明这些微卫星位点具有较高的多态性。(3)广西地区临床株PM和竹鼠体内寄生株PM的遗传相似系数为0.8502,遗传距离为0.1623;广西各个地区人PM的遗传相似系数在0.5516～0.8364;各个地区竹鼠PM遗传相似系数在0.4503～0.6384之间;各个地区人PM和竹鼠PM微卫星比较,遗传相似系数在0.2986～0.8364之间,遗传距离为0.1787～1.2086。(4)根据遗传聚类图将其基因分为5型。结论广西地区银星竹鼠体内寄生PM与广西马尔尼菲青霉病患者(PSM)分离PM均具有高度的基因多态性:引起人类PSM的病原菌与广西野生竹鼠自然携带PM在遗传分析上有着较高的遗传相似性。