鼠伤寒沙门氏菌小RNA功能的研究

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沙门氏菌(Salmonella)属肠杆菌科(Enterobacteriaceae),革兰氏阴性肠道杆菌。沙门氏菌广泛存在于自然环境及动物的肠道中,沙门氏菌大多数能引起家畜,鼠类和禽类等动物的疾病,但有时也可污染人类食物,引起食物中毒。据统计,沙门氏菌引起的食物中毒的案例常列榜首,中国内陆地区也以沙门氏菌为首位。   鼠伤寒沙门氏菌是沙门氏菌属中引起人类急性肠胃炎的主要病原菌之_,并且在小儿和老人中最为常见。作为研究沙门氏菌的典型模式细菌,目前对鼠伤寒沙门氏菌的致病作用的研究虽然有了一定的进展,但是还是有很多具体的致病机理尚不清楚。因此,对于鼠伤寒沙门氏菌转录组中小RNA的相关实验,将会有助于鼠伤寒沙门氏菌乃至致病性细菌的致病机理更详尽的研究。   本实验利用Solexa高通量测序技术对特定条件下的鼠伤寒沙门氏菌提取的总RNA的数据进行分析,通过生物信息学的方法预测4个转录水平显著的小RNA;利用Northern blot技术去验证预测的小RNA;利用λ噬菌体Red重组系统去构建小RNA缺失突变菌株;测定鼠伤寒沙门氏菌以及小RNA缺失突变菌的生长情况等生理生化实验;利用小RNA缺失菌株及野生菌株对鼠巨噬细胞的侵染实验来完成小RNA缺失菌株的毒力评价研究;利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)观察特定情况下小RNA缺失菌株致病岛的区域重要相关毒力基因的表达情况;利用RACE(cDNA末端快速扩增)技术获得完整的小RNA长度。   本实验通过生物信息学的方法成功预测4个特定条件下转录水平显著的小RNA,并且利用Northern blot技术验证了预测的小RNA,分别命名为wl_sRNA01,w1_sRNA02,w1_sRNA03,w1_sRNA04。正确构建出4个小RNA的缺失突变株,并且和野生株在LB培养基中测定生长状况,结果表明这四个小RNA的缺失对鼠伤寒沙门氏菌的生长代谢没有造成非常显著的影响。在小RNA缺失突变株以及野生菌侵染鼠巨噬细胞的试验中,通过多次重复,发现小RNA的缺失使鼠伤寒沙门氏菌对鼠巨噬细胞的入侵和体内生存复制有不同程度的影响;在进一步试验中,RT-PCR显示小RNA的失去对控制鼠伤寒沙门氏菌的入侵和体内生存的致病岛也有非常重要的影响,为进一步研究小RNA的功能奠定了基础。
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