本文使用具有不同晚疫病抗性的番茄栽培种(L.esculentum)、常规杂交F1代、F2代以及野生种(L.pimpinellifolium)为试验材料，在人工气候箱和塑料大棚条件下栽培，通过人工接种晚疫病菌、自然条件下发病株的调查和相关的分子标记技术，对所取得的数据应用不同软件进行分析，达到获得番茄杂交新品种和抗晚疫病育种理论基础的目的。 试验获得如下结果：1.26份番茄栽培种和1份野生种在遗传多样性方面可以划分为5个类群，其中前4个类群为栽培品种，野生种构成独立的1个类群，为杂交育种的亲本选择提供依据。 2.普通番茄感病5号自交系与高抗晚疫病自交系CLN2037E以及它们杂交F1、F2代植株为材料，从41对SSR标记中筛选出一个标记TOM236，该标记位于第9号染色体上，与晚疫病抗性基因的连锁距离为5.7cM。同时证实了番茄自交系CLN2037E中的晚疫病抗性由一对纯合显形基因控制，属质量性状遗传。 3.在番茄抗晚疫病生理及细胞超微结构变化研究方面，试验得到：MDA、H2O2和SOD指标在F1中表现为偏向于感病母本5号自交系一方，不呈现显性关系；PPO指标在F1中表现是介于两个亲本中间，不偏向于其中的一个亲本；POD指标在F1中表现趋同于抗性父本CLN2037E，表现为显性遗传；不同番茄品系光合速率存在很大差异，与品系固有特性有关，在受到晚疫病侵染时，感病品系光合速率下降很快，而抗病品系受到的负面影响要小得多；感病5号自交系及其F1细胞超微结构中出现过氧化物酶体较早，多个细胞器受到的破坏程度比抗性父本CLN2037E严重，细胞结构的解体相比抗性父本较早。在F1中也表现出趋同于感病母本一方，表现出隐性遗传的特性。 4.应用常规杂交技术选育出了番茄杂交新品种“云杂8号”，进行了大面积示范推广。 5.通过从番茄幼苗真叶和干种子中分别提取DNA，用RAPD技术对F1代种子进行纯度检验，筛选到引物BS273能在F1中同时扩增出父、母本特异带的引物，从而用一个引物便可以进行可靠的F1代种子纯度鉴定。 本试验致力于番茄常规杂交育种和抗晚疫病育种的遗传和生理方面，一系列的试验结果为进一步新品种培育提供参考和理论依据。