科技作为促进经济建设社会发展的重要力量已引起了国家财政部门的高度重视，体现为政府不断加大对科技战略研究的支持和科技资金的投入，但是总体上看我国科学技术发展仍旧处于较为落后的水平。鉴于科技项目财政资金支出管理与财政资金使用在经济性、效率性和效益性的方面存在着绩效缺失，这就要求我国在科技发展的过程中需要提高对科技项目财政资金管理的水平。所以科学的绩效评价作为科技资金管理现代化和决策科学化的重要内容和基础性工作，其发展的重要性日益突出。为此，我国政府颁布了一系列管理办法，科技部发布了《国家科技计划项目评价评审行为准则与督查办法》，并引发了《科学技术评价办法》（试行），财政部也出台了《中央部门预算支出绩效考评管理办法》，财政部教科文司也颁布了《中央级科教文部门项目绩效评价管理办法》，以引导和规范科技支出项目的绩效评价工作。绩效评价指标体系的构建是科技支出项目绩效评价工作的核心环节，同时也是绩效评价行为在实际运行中的实质内容。因此，设计并构建一套针对财政科技支出项目的绩效评价指标体系，对于顺利开展项目实施过程及实施后的效果评价工作、提高资源利用的效率和效益、增强科技财政支出管理与决策水平、促进与激励优秀科技人才以及提升社会和经济的可持续发展等都具有重要意义。本文在总结已有的财政科技支出项目绩效评价研究成果以及结合我国当下财政科技支出项目绩效评价实务现状的基础上，针对现有财政科技支出项目的绩效评价指标体系存在的缺陷，结合科技项目的特点对财政支出项目的绩效进行分析，选择定性分析与定量分析相结合的评价方法即首先选用德尔菲法确立三个层级的各层次具体指标继而使用层次分析法构造评价指标权重判断系数矩阵，运用Expert choice2000软件计算得出各个评价指标的权重并进行一致性检验，最终完成建立科学合理、具有较强实务性的财政科技支出项目绩效评价指标体系的设计工作。