桃(Prunus persica[L.] Batsch)原产中国，是世界上栽培范围最为广泛的树种，也是蔷薇科李属重要的核果类果树。果实质地与酸度是果实品质的重要指标，硬溶质可延长桃的货架期，酸含量是决定果实口感的主要因素之一。但不同的遗传群体其遗传基础目前仍不清楚，蕴藏着较大的研究价值。我国是桃的起源地，资源丰富，因此有必要探索与质地和酸度相关联的分子标记，从而在分子水平上阐明其遗传机理，了解其遗传特性，这对培育高品质桃品种具有重大意义。本研究利用8个高多态性的SSR标记对亲本组合‘Chula’ב02-25-106’及其593个杂交后代在ABI3130测序系统中进行亲子鉴定，选择出真杂种为杂交群体，采用Iluminapeach9K SNP芯片对亲本及筛选的杂交群体进行SNP位点检测，构建遗传连锁图谱以及简单性状的全基因组关联分析和QTL定位。主要结果如下:　　1.杂交实生苗的亲子鉴定及分析　　从桃T×E遗传连锁图谱上选取均匀分布于8条连锁群上的16对SSR引物，以母本‘Chula’和父本‘02-25-106’为模板，进行SSR测试，从中筛选出8对具有父本特征性条带且清晰的SSR引物。对595份桃叶片（包含亲本）DNA进行SSR扩增，结果表明，具有父本特征条带的真杂种有386个。从鉴定出来的真杂种中筛选出220个已有果实表型数据记录的子代用于Illumina peach9K SNP芯片基因分型。　　2.桃杂交群体SNP遗传图谱构建　　利用Illumina peach9K SNP芯片对两个亲本和216个F1子代进行基因分型，产生8，144个SNP位点，利用JoinMap4.0对这些位点进行筛选，去除没有多态性的位点，共得到3，506个SNP位点，多态性比率为43.1％。根据卡方检验，去除子代中出现偏分离的SNP位点，最终构建得到一张由216个个体包含1，021个SNP位点的高密度图谱。这1021个SNP位点分布于桃的8条连锁群上，图谱全长529.7cM，平均距离为0.53cM，基因组平均覆盖度为91％，每1个cM有1.92个SNP。　　3.基于Illumina peach9K SNP芯片的全基因组关联分析及QTL定位　　对亲本及F1子代的成熟期、单果重、果实硬度、肉质、酸甜度、着色度、香气等7个表型性状的数据进行统计与分析，采用复合区间作图法筛选与这些性状相关的QTLs位点。本研究中主要分析了与质地（软溶质和硬溶质）和酸度相关的QTLs，其结果如下:共检测到与这些表型性状相关的13个QTLs，QTL定位结果分为三类。在双亲都分离的类型中与酸度关联的QTL有2个，均位于第5连锁群上，其中表型变异解释率最高为86.7％，与其关联的SNP标记为SNP_IGA_545261，其中基因型为AG和AA与低酸性相关，基因型为GG与酸性较高相关。与质地性状关联QTL有5个，分别位于LG3、LG4、LG7、LG8上，其中位于第7连锁群上的QTL表型变异解释率最高，为52.5％，与其关联的SNP标记为SNP_IGA_787064，其中基因型为TC与软溶质相关，与硬溶质相关的基因型不明显。在母本分离类型中，发现与酸关联的QTL位于第5连锁群上，表型变异解释率为30.0％。在父本分离类型中，与酸关联的QTL有4个，其中有3个在第5连锁群上，1个在第6连锁群上，表型变异解释率最高的为26.7％;而与质地关联QTL位于第4连锁群上，表型变异解释率为6.3％。