基于核基因内含子序列变异探讨震旦鸦雀(Paradoxornis heudei)种群遗传分化

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:nwhitewolf
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震旦鸦雀(Paradoxornis heudei)隶属于雀形目(Passeriformes)鸦雀科(Paradoxomithidae)鸦雀属(Paradoxornis),主要分布在我国东北地区、中东部、内蒙古东北部和西伯利亚东南部,是东亚地区的特有种,且被世界保护联盟(IUCN)在红色名录中列为全球近危种。本研究以长江下游平原湿地、华北平原湿地、东北平原湿地及三江平原湿地震旦鸦雀的13个地理种群306个个体为研究对象,基于8个核基因内含子的位点变异,探讨了各地方种群遗传多样性与遗传结构,分析了冰期气候变化对震旦鸦雀种群动态的影响。主要结果如下:1.8个核基因内含子序列长度分别为15743(628bp)、ACLY-16(859bp)、GADPH(341bp)、ODC(735bp)、RPL30-3(1122bp)、TGFβ2(592bp)、VLDLR-7(607bp)、βACT-3(457bp),合并序列后全长(All-8)为5341bp;变异位点分别为4(15743)、3(ACLY-16)、7(GADPH)、6(ODC)、10(RPL30-3)、1(TGFβ2)、2(VLDLR-7)、4(βACT-3)、37(All-8)个;分别定义了6(15743)、5(ACLY-16)、11(GADPH)、13(ODC)、16(RPL30-3)、2(TGFβ2)、3(VLDLR-7)、7(βACT-3)、352(All-8)个单元型。2.震旦鸦雀核基因内含子变异较小,其遗传多样性较低。不同的核基因内含子变异在不同的地方种群表现并不相同,北方种群的单元型及核苷酸较低。种群的遗传分化分析表明,多数种群间具有显著的遗传分化。3.基于遗传距离构建的地理种群之间的系统发生树表明,位于黄河下游的东营、封丘及衡水种群在历史上较早演化形成,而东北地区的齐齐哈尔、福利屯、盘锦种群则较晚。核基因内含子序列变异揭示震旦鸦雀种群具有微弱的系统地理结构。4.BEAST分析表明,震旦鸦雀的有效种群大小在距今约32,500年前有较快的增长,而在距今11,000年以后有效种群大小基本不变。在末次冰期的冰盛期,震旦鸦雀种群处于增长状态,可能并不存在冰期避难所。冰期的气候变化本身并未对震旦鸦雀的种群动态产生较大的影响,而海侵与海退则是影响震旦鸦雀的种群动态的主要因素。
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