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矮秆波兰小麦(TriticumpolonicumL., AABB,2n=4x=28,Dwarfing Polish Wheat, DPW)是一份来自中国新疆吐鲁番的具有特异矮秆性状的波兰小麦材料。它所携带的矮秆基因是由一对隐性基因控制,将其暂定名为Rht-dp。本试验选用矮秆波兰小麦(AS302)和高秆波兰小麦(AS304)为亲本进行杂交,建立F2分离群体,用SSR和AFLP技术对该四倍体小麦的矮秆基因进行分子标记；并用Rht-B1b的特异引物BF-MR1初步进行了同源性检测。1、本试验共选用187对小麦A、B染色体的SSR引物和184对AFLP引物进行分析。在高秆、矮秆亲本间进行PCR扩增,分别有65对SSR引物和67对AFLP引物表现出差异性,分别约占所用引物的34.76%和36.41%。将已筛选的65对SSR引物和67对AFLP引物结合BSA方法在矮、高池间进行扩增,发现SSR引物WMC511Xgwm495、Xgwmll3、Xgpw7026、Xgwml92、Xgpw7521、Xgpw3017、Xgpwll08和AFLP引物M8E5、M4E3表现出多态性。进一步用这10个标记对F2群体124个单株进行PCR扩增,结果表明这些引物与Rht-dp连锁,并将该矮秆基因初步定位到4BS上,利用Mapmaker3.0软件计算遗传距离,结果显示,Rht-dp位于Xgpw7521、 Xgpw7026、Xgpwll08、Xgwml92、Xgwm495、WMC511、 M8E5和Xgpw3017、M4E3、 Xgwmll3之间,它们的排列顺序是Xgpw7521-Xgpw7026-Xgpw1108-Xgwm192-Xgwm495-WMC511-M8E5-Rht-dp-Xgpw3017-M4E3-Xgwm113,遗传距离分别为17.7cM、5.3cM、5.1cM、2.2cM、8.4cM、2.0cM、3.5cM、0.5cM、4.5cM、0.3cM。该研究结果为标记辅助育种、进一步精细定位和图位克隆Rht-dp基因奠定了基础。2、用Rht-B1b基因的特异引物BF-MR1分别扩增Rht-dp和Rht-B1b,得到了相同大小的扩增片段,并分别对得到的片段进行克隆测序,比对结果表明,两个片段的序列完全一致,说明Rht-dp可能是Rht-B1位点上的一个候选基因。