随着经济全球化的不断发展,技术创新活动所带来生产效率的提高已经成为推动经济增长和促进社会繁荣最重要的因素。R&D投资是企业形成技术创新能力的基础,也是企业获得优势技术的必经途径,对公司绩效和核心竞争力的提升具有重要意义。在经济人假设的前提下,公司高管作为R&D投资决策的制定者和实施者,其自利动机不仅会影响到R&D投资决策,也会对资源配置产生影响,从而影响R&D项目的执行效果,最终影响公司绩效。本文从微观企业层面和财务视角出发,利用来自中国资本市场的数据,对高管自利动机下的R&D投资与公司绩效之间的关系予以理论分析和实证研究。　　首先,理论部分从相关概念的界定出发,结合企业能力理论、委托代理理论以及动态内生性理论分析框架,对R&D投资与公司绩效之间的相互作用关系以及高管自利动机对其产生的影响进行理论分析;其次,实证部分根据之前的理论分析提出相应的研究假设,同时选取中国A股主板市场107制造业上市公司2004-2010年平衡面板数据为研究样本;接着,运用Excel、Stata11.0统计软件对各变量进行描述性统计分析;最后,采用平衡面板数据和系统GMM估计方法进行实证检验并得出研究结论。　　本文的实证结果发现:(1)在控制住动态内生性的影响后,当期和前两期R&D投资对当期的公司绩效都有显著的促进效应,且滞后两期的促进作用最明显;当期和前两期公司绩效对当期R&D投资也呈现出显著的正相关关系,且滞后一期的正向作用最明显;(2)高管权利越大(即董事长兼任总经理)越不利于R&D投资和公司绩效的提高;高管是否持股对公司绩效有显著的正向影响,但与R&D投资负相关;高管持股比例大小对公司绩效有正向影响但不显著,对R&D投资有显著的正向影响;高管薪酬对公司绩效显示出较强的正向影响,但对R&D投资无显著作用;高管任期与R&D投资呈倒U型关系,高管年龄与R&D投资负相关;(3)非国有企业的R&D投资对公司绩效影响程度以及股权激励、薪酬激励的效果都要优于国有企业。最后根据研究结论,从利益分配机制、内部治理机制和市场机制等方面提出实现公司R&D资源合理配置和绩效不断提升的政策建议。