LncRNA BC040587调控酸性微环境下肾癌769-P细胞的功能和分子机制研究

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目的:通过基因编辑系统CRISPR/Cpf1稳定敲除肾癌769-P细胞中的长链非编码RNABC040587(LncRNABC040587),并初步研究该LncRNA在酸性微环境下调控肾癌769-P细胞的功能和分子机制。方法:使用基因编辑技术CRISPR/Cpf1敲除肾癌769-P细胞中的LncRNA BC040587,得到769-PBC040587(-)细胞并通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)来检测敲除效率。通过肿瘤细胞体外侵袭实验(Transwell实验)检测酸性微环境下769-PBC040587(-)细胞侵袭能力的变化;通过蛋白质印迹法(Western blot实验)观察酸性微环境下769-PBC040587(-)细胞中Snail和pAKT蛋白的表达变化情况。此外,还通过USUC数据库找寻LncRNABC040587上下游1M以内的邻近基因,并通过使用qRT-PCR检测其在对照组769-PVector细胞和实验组769-PBC040587(-)细胞中的表达有无差异,挑选可能与LncRNABC040587发挥生物学功能有关的基因。然后通过使用siRNA进一步降低769-PBC040587(-)细胞中相关基因的表达并通过Western blot实验观察相关信号通路有无改变。结果:qRT-PCR结果表明实验组细胞(肾癌769+PBC040587(-)细胞)中LncRNA BC040587的表达量显著低于对照组(肾癌769-PVector细胞)(P<0.05)。Transwell实验结果表明酸性微环境下肾癌769-PVector细胞侵袭能力增强,而肾癌769-PBC040587(-)细胞在酸性微环境下其侵袭能力无明显变化。Western blot实验结果表明,酸性微环境下肾癌769-PVector细胞中Snail和pAKT的表达水平上升(P<0.05),而肾癌769-PBC040587(-)细胞在酸性微环境下Snail和pAKT表达水平变化无明显差异。qRT-PCR结果发现假基因RNU6-1200P和假基因RN7SL815P在769-PBC040587(-)细胞中稳定高表达(P<0.05)。使用siRNA将769-PBC040587(-)细胞中假基因RNU6-1200P和假基因RN7SL815P的表达下调。Western blot实验结果表明,实验组(769-PBC040587(-)细胞中假基因RNU6-1200P表达下降后,酸性微环境下作用1h组)与对照组(769-PBC040587(-)细胞酸性微环境下作用1h组)相比pAKT的表达增强(P<0.05);另一实验组(769-PBC040587(-)细胞中假基因RN7SL815P表达下降后,酸性微环境下作用1h组)与对照组(769-PBC040587(-)细胞酸性微环境下作用1h组)相比pAKT的表达下降(P<0.05)。结论:LncRNABC040587是酸性微环境诱导肾癌769-P细胞侵袭能力增强的关键基因,该LncRNA通过调控Snail和pAKT发挥其生物学作用。假基因RNU6-1200P 是 LncRNABC040587 的下游调控位点并且在 LncRNABC040587调控pAKT中起到重要作用。肾癌769-P细胞中可能存在酸性微环境/LncRNA BC040587/假基因RNU6-1200P/pAKT途径调控细胞侵袭进程。
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