本研究对吉林省梅花鹿主产区鹿茸茸重与茸尺指标进行相关性分析,明确影响茸重的关键茸尺指标,建立茸重估测模型。应用竞争性等位基因特异性PCR分型技术（KASP）对本实验室前期通过东大、四平梅花鹿两个群体中筛选出的9个与产茸量相关的SNP位点（其中2个位于外显子上）,在190头梅花鹿个体中进行了验证。进一步挖掘影响梅花鹿产茸性状的候选基因及变异位点,利用飞行质谱SNP分型技术对可能影响梅花鹿产茸性状的候选变异位点进行检测,并与产茸量进行关联分析。结果如下:1、本研究以吉林省鹿茸主产区的872枝梅花鹿鹿茸为研究对象,测量鹿茸茸重、茸尺数据。对所有数据进行偏相关性分析、主成分分析并建立茸重估测模型。结果表明:二杠茸、三杈茸左右枝无显著差异,对称性较高。二杠茸型中,两侧茸重与主干长度相关性最高（P<0.01）;第一、二主成分是围绕二杠茸主干部分的综合反映。在三杈茸型中,两侧茸重与主干围度为相关性最高（P<0.01）;第一、二主成分是对三杈茸主干部分的综合反映,第三主成分是对分枝部分的综合反映。通过回归分析,建立两种茸型左右两侧共4个鲜茸重估测模型并进行检验,所建立的茸重估测模型为:二杠左枝:Y2L=-1.641+0.028X1+0.051X2+0.018X3+0.014X4+0.027X6（R2=0.815,P<0.01）二杠左枝:Y2R=-1.619+0.033X1+0.033X2+0.008X3+0.045X4-0.008X5+0.0318X6（R2=0.798,P<0.01）三杈左枝:Y3L=-3.793+0.034X1+0.132X2+0.014X3+0.074X4+0.030X6（R2=0.881,P<0.01）三杈左枝:Y3R=-3.686+0.022X1+0.089X2+0.112X4+0.034X6+0.019X7+0.035X8（R2=0.839,P<0.01）。2、对实验室前期经东大、四平梅花鹿群体筛选出的9个与产茸量显著相关的SNP位点,运用KASP分型技术,在7个群体的190头梅花鹿个体中进行验证。结果表明:8个位点分型成功,7个位点具有多态性。利用7个位点信息对梅花鹿群体进行遗传多样性评估,结果显示:有3个SNP位点为低度多态性位点,4个SNP位点为中度多态性位点,多态信息含量（PIC）平均值为0.232;观测杂合度（Ho）平均值为0.265,期望杂合度（He）平均值为0.282;有效等位基因数（NE）平均值为1.91,接近实际检测等位基因数2。综合上述结果表明该梅花鹿群体的遗传多样性低。运用一般线性模型对多态性SNP位点与产茸量进行关联分析,发现7个位点与产茸性能均不存在显著相关性（P>0.05）。在SNP307156位点中,存在与已知结果相同的CC基因型,产茸量约为4.6kg。3、运用飞行质谱分型技术,对7个梅花鹿养殖场采集的188头梅花鹿样本的130个SNP位点进行分型。运用一般线性模型对SNP位点与梅花鹿产茸性状进行关联分析,结果表明位点SNP3761776与产茸性状极显著相关（P<0.01）,高产基因型为GG。组建验证群体,对验证群个体基因型与茸重进行多重比较,结果显示:GG基因型平均产量为4.99kg,极显著高于CG基因型平均产茸量3.54kg（P<0.01）。对位点所在位置进行基因功能注释,发现其位于HMG20A基因上游区域。进一步分析发现,该基因可能参与鹿茸的生长调控。