精神分裂症是最严重的精神疾病之一,以基本个性改变,思维、情感、行为的分裂,精神活动与环境的不协调为主要特征,在全世界各个人群中普遍存在,发病率均在1%左右。精神分裂症是一种具有高度遗传性的复杂疾病,在亲代间的传递不遵循简单的孟德尔遗传模式,其致病原因可能涉及到多个微效基因间的相互作用以及环境因素的影响。研究者提出了多种的假说,但是尚无一种假说能解释其所有的病因学改变,具体分子机制仍然是一个谜。目前,对精神分裂症在遗传学水平上的发病机理的主要研究手段是通过连锁分析或连锁不平衡(关联)分析来定位相关的候选基因。谷氨酸是哺乳类动物中枢神经系统的主要的兴奋性神经递质。近年来,精神分裂症的谷氨酸假说越来越受到精神医学界的关注,谷氨酸受体系统在精神分裂症病理机制中的潜在作用越来越受到重视。在本论文中,我们叙述了谷氨酸的海人藻酸(KA)受体的GRIK4基因与精神分裂症的连锁不平衡分析。GRIK4基因定位于11q22.3,编码高亲和力KA受体亚基KA1。我们对GRIK4基因上的5个SNP基因分型并进行连锁不平衡分析,其中的3个SNP被报道在苏格兰人群中与精神分裂症关联。我们使用了总计576份中国汉族人群的样品,包括288例散发病例和288例正常对照,进行了病例-对照关联分析研究。结果表明,无论是通过单个位点分析还是单倍型分析,我们都没有发现GRIK4基因与精神分裂症相关的证据。在分子遗传学研究中,单倍型信息是研究致病基因、进行连锁分析和关联分析的一个重要数据基础。分子技术方法虽然能够直接测量个体的单倍型信息,但是因其耗费时间且花费太高而不被广泛应用。更多的是利用统计方法从未含连锁相信息的基因型数据中推断单倍型信息。目前已有多种算法,如Clark’s算法,EM算法,Bayesian方法等等。EM算法是公认的最为稳定的算法,但是由于计算机存储能力等的限制,它在解决较多位点及多等位基因位点数据时或费时太长,或不能解决。为了克服上述缺点,本论文结合了Partition Ligation和Combination Subdivision策略,对标准EM算法进行了改进,开发了PL-CSEM程序,并用大量数据测试了程序的性能。结果表明,该程序不仅能够较好处理多等位基因位点数据,而且处理多位点SNP数据的能力也优于Qin等开发的PLEM。