中国汉族2型糖尿病患者的关联分析及基因型交互作用研究

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目的通过对候选基因的单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族2型糖尿病(T2DM)患者相关表型之间的关联及基因型交互作用分析,来探讨候选基因SNPs与高血压、血糖、血脂及胰岛素抵抗表型的相关性。候选基因的选择主要依据我们先前的关联分析结果和基因的生物学功能,以及结合已报道的T2DM、肥胖和血脂的全基因组关联分析(GWAS)研究结果。方法收集909名来自中国北方天津地区的T2DM患者,记录这些患者的一般情况及相关的临床生化指标,并采用高盐法提取其外周全血基因组DNA。应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术,对37个候选基因的59个SNPs位点进行基因分型,并且应用PLINI软件对高血压、血糖、血脂及胰岛素抵抗等相关表型进行关联分析,同时进行候选基因的SNPs与相关表型的交互作用分析。结果1.二分变量关联分析显示,ABI2基因的rs62183937、rs11675251、rs3731652和rsl376877位点与高血压的发病状态相关(P值分别为1.823×104、0.008、0.009和0.020)。2.我们发现CDKAL1基因的SNPs位点与体重相关,即rsl0946398和rs7756992位点分别与体重指数(BMI)有相关性(P值分别为0.007和0.021);这两个SNPs位点分别与空腹血糖和空腹胰岛素的比值(FPG/FINS)也相关(P值分别为0.007和0.021)。MYH9基因的多个SNPs位点(rs2269532、rs2071731和rs739097)分别与糖化血红蛋白(GHbA1c)表型相关(P值分别为0.015、0.015和0.023),其中,该基因的rs739097位点也与2小时血糖(P2hG)表型相关(P=0.006)。3.AB12和MYH9基因的SNPs位点的单倍型分析:ABI2基因的rs62183937-rs11675251-rs3731652-rsl376877"G-A-G-C"单倍型与高血压表型相关(P=3.076×10-4)。同时,MYH9基因的rs735853-rs875726-rs2009930"G-A-T"单倍型与脑血管病相关(P=0.001),并且该单倍型也与总胆固醇(TC)表型相关(P=0.006)。4.二分变量的基因交互作用结果显示,SLC30A8基因的rs13266634位点分别与MYH9基因的rs2269532和rs2071731位点在高血压表型中存在交互作用(P值分别为9.087×10-4和9.087×10-4)。SFI1基因的SNPs (rs5749286和rs5753669)位点分别与IRS1基因的rs7578326位点在高血压表型中存在交互作用(P值分别为2.588×10-4和1.959×10-4)。5.数量性状的基因交互作用分析显示,ABI2基因的rs62183937位点分别与TBX5基因的rs11067076和rs11067083位点在空腹血糖(FPG)表型中存在交互作用(P值分别为1.220×10-7和8.920×10-6)。同样,ABI2基因的rs3731652位点分别与TBX5基因的rs11067076和rs11067083位点在FPG表型中也具有交互作用(P值分别为1.150×10-6和1.010×10-5)。在定量胰岛素敏感性检测指数(QUICKI)表型中存在多个基因的交互作用,即ABI2基因的rs62183937、rs11675251和rs3731652位点分别与ABCG2基因的rs2231142位点存在交互作用(P值分别为1.350×10-5、3.730×10-5和3.280×10-5),同时,ABI2基因的上述三个SNPs (rs62183937、rs11675251和rs3731652)位点分别与TOX基因的rs1526167位点在该表型中存在交互作用(P值分别为5.529×10-4、9.785×10-4和8.496×10-4)。结论在本研究中,我们完成了909例T2DM患者的37个候选基因的59个SNPs位点的基因分型。结果表明,在ABI2、MYH9、CDKAL1、SLC30A8和TBX5基因的SNPs位点与T2DM相关临床表型具有相关性并且存在基因交互作用。特别是ABI2基因的SNPs位点与高血压、血糖和其它与血糖、胰岛素抵抗相关的表型均具有广泛相关性。同时,本研究显示ABI2基因和TBX5基因的SNPs位点之间在血糖相关表型中存在显著的基因型交互作用;以及MYH9和SLC30A8基因的SNPs之间在高血压表型中也存在基因型交互作用。
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