西南地区是我国生物多样性最丰富的地区,为34个世界生物多样性的热点地区之一。本文依据各种文献资料和标本数据,从宏观尺度上对该地区维管植物的地理分布格局进行研究,进而利用空间相关分析法识别物种丰富度的热点地区并确定优先保护区域,最后通过GAP分析法鉴别目前国家级自然保护区的保护空缺。主要研究结果为:一、西南地区维管植物共24070种(包括亚种及变种),隶属于310科、2547属,包括被子植物22135种、裸子植物154种、蕨类植物1781种。其中特有种11678种,占总物种数的48.52%。被列入《国家重点保护野生植物名录》一级保护的有191种,二级保护的有1208种。二、依据《中国生物多样性红色名录-高等植物卷》得到物种的受威胁等级结果为:绝灭(EX)9种(0.04%)、野外绝灭(EW)4种(0.02%)、地区绝灭(RE)6种(0.02%)、极危(CR)298 种(1.24%)、濒危(EN)768 种(3.19%)、易危(VU)1196 种(4.97%)、近危(NT)1678 种、无危(LC)15660 种、数据缺乏(DD)1818种。三、在省级尺度上,云南省分布物种数最多,共有16766种,占研究区总物种数的 69.65%,其次为四川(12805 种,53.19%)、西藏(8280 种,34.40%)、贵州(7499种,31.15%)、重庆(6363种,26.43%)。在县级尺度上,西南地区维管植物集中分布在喜马拉雅山东段、横断山局部、西双版纳及滇东南等地区,物种丰富度最高的25个县代表了 18041种物种,占该地区维管植物的74.95%。四、本文利用空间相关分析法的G~i(?)系数分别得到西南地区维管植物的受威胁物种、特有种和稀有种的热点地区,并基于这三种热点地区最后确定了优先保护区,主要分布在喜马拉雅山脉东段、横断山局部、四川盆地西北部、渝鄂交界大巴山地、喜马拉雅山与拉轨岗日山交界、哀牢山地区、西双版纳地区和滇东南地区。以上优先区总面积为2696万公顷,占西南地区总面积的11.46%,共代表物种数为20153种,占研究区所有物种数的83.72%。五、截止2014年,西南地区已建立各种类型的保护地,包括自然保护区210个(国家级76个,省级134个),总面积达5036.61万公顷;其他类型保护地共计274个,包括116个国家森林公园、62个国家湿地公园、52个风景名胜区、44个国家地质公园。将得到的优先区与现有国家级自然保护区叠加后进行保护空缺分析,结果表明保护空缺主要分布在四川的西北及西南地区,云南的滇西北和滇东南,西藏的喜马拉雅山东段以及重庆大巴山地区。这些地区在下一步规划中应受到重点保护。本研究对于西南地区植物多样性保护具有重要意义,同时可为完善保护地网络提供科学的依据和决策。