随着全球环境恶化和化石能源枯竭,人们对可再生清洁能源的研究不断深入。沼气作为一种可再生、高能值的清洁能源成为社会各界的研究热点。目前我国沼气研究主要集中在户用沼气和畜禽养殖场沼气工程发展模式的定性分析,对沼气工程生产效率及其影响因素的定量研究比较滞后,加大了分析畜禽养殖场沼气工程运行状况和效益的难度。四川省是全国沼气工程最多的省份,在中国沼气“三起两落”发展历程中扮演重要角色,对四川省畜禽养殖场沼气工程生产效率影响因素的研究具有一定代表性和典型性,对不同地形沼气工程提质增效也具有一定参考价值。基于此,本文以外部性理论、规模经济理论、经济增长理论和生态循环农业理论为理论基础,采用DEA-Malmquist指数法和Tobit模型对2012-2016年四川省92个沼气工程进行数据测算,通过全要素生产率变动分析和计量研究,探究其主要影响因素,以期能丰富和完善沼气工程全要素生产率影响因素的理论研究,为四川省畜禽养殖场沼气工程的规划和实践提供建议和参考。根据实证研究结果得出以下结论:(1)不同规模和不同经济区沼气工程综合技术效率都呈现逐年上升趋势;(2)四川省畜禽养殖场沼气工程的全要素生产率随工程规模效率增大而提升;(3)环境规制和政府补贴易造成沼气工程综合技术效率的大幅度波动;(4)运行管理成本对全要素生产率呈负向影响,COD量、学历水平、沼气技术人员持证水平、政府补贴金额对沼气工程全要素生产率呈正向影响。综上,为进一步提高四川省畜禽养殖场沼气工程的全要素生产率,提出以下政策建议:(1)鼓励发展专门从事粪污处理的第三方沼气工程企业,降低沼气工程对养殖场效益的依赖程度,实现粪污处理产业化发展,促进沼气产业“三产融合”;(2)完善畜禽养殖场及沼气工程的市场准入制度,提高补贴力度,适当提高补贴门槛,加强对沼气从业人员培训,以提高全省沼气工程整体质量;(3)将政府补贴由沼气工程的前端建设向沼气工程后端产物转移,实现沼气工程持续、健康发展。