在医药行业，医药电子商务的引入促进了药品流通的高效性，但是由于自身的特殊性-对流通运输的高要求，依旧有不少医药企业在药品流通环节低效而且运作费用居高不下。这一方面在无形中增加了药品成本，抬高了药价，进而给普通消费者增添了许多不必要的经济负担；另一方面，从医药行业流通现状来看，流通环节的低效正成为企业自身发展过程中一个不得不正视的现实问题。因此如何解决物流在医药电子商务的流通是当下医药系统的一个迫切任务。 本文在阐述了医药电子商务与物流的关系的基础上，详细分析了医药行业目前所使用的第三方物流及未来可使用的第四方物流，并对目前使用第四方物流的成功案例进行了剖析总结，得出企业或是一个行业成功采用第四方物流必须具备以下几个条件：掌握先进的物流技术、拥有技术过硬的供应链管理人员、有良好的信息共享平台、有足够的供应链管理能力以及拥有全球化的地域覆盖能力和资源支持能力。利用这几个条件并结合医药行业的特点，对医药行业采用第四方物流的可行性进行了分析，得出我国医药电子商务具备采用第四方物流的潜质。最后对第四方物流在医药电子商务中的实际运作进行了进一步的阐述，且从用户操作第四方物流电子商务平台的角度做了诠释。