随着科技和信息技术的发展，数据采集与存储系统在各行各业取得了广泛的应用。然而随着人们需要采集和处理越来越多的数据，对于数据采集与存储系统的各项性能如采样频率、数据处理和存储速度等提出更高的要求，因此如何实时、高速、连续地采集和存储数据是一个关键的问题。半导体制造工艺的提高带动FPGA技术的快速发展，给数据采集与存储系统性能提升提供新的解决方案。本文正是基于上述要求，设计了一套通用型的高速数据采集与存储系统。提出以FPGA为控制核心，以双CF卡作为存储介质，以USB接口作为数据输出接口，完成对高频模拟信号的数据采集、保存和传输功能。在FPGA内部建立以Nios II软核为核心的片上控制系统，既增强了设计的灵活性又保留了FPGA并行处理的优势；利用双CF卡做为存储介质来实现对数据的连续采集和高速存储，通过移植广泛使用的FAT32文件系统，解决CF卡内数据的高效管理问题；采用USB2.0接口将CF卡中的数据上传给计算机做进一步处理或归档。最后对本系统的各项性能进行全面的测试和分析，并对存在的问题提出改进的措施和建议。