会计人员运用相关的会计原则，建立在权责发生制的基础上对财务报表进行编制，由于所有权与经营权相互分离，代理人为了实现自身的利益而进行盈余管理。公认会计原则的局限性为盈余管理创造了很多机会和空间，而盈余管理的存在会削弱财务报告所提供盈余信息的可靠性。一些会计处理的灵活性掩盖了企业真实的经营业绩，而这些将使我们无法识别公司真实的经营业绩。上市公司的财务数据失真，不能准确的反映公司的经营状况，成为一些外部信息使用者—投资者，债权人，政府，及审计人员，金融分析师需要花大量时间和经历考虑的问题。如何建立健全内部控制使会计信息真实可靠,一直是现代会计研究的一个重要课题。近年来,一系列由于内部控制缺陷导致经济犯罪案件频繁发生。从1995年巴林银行的倒闭，再到2001年安然公司的瓦解，到2012年的老酸奶事件，无不与上市公司内部控制的缺陷息息相关。导致接连不断出现会计丑闻，究其原因是内部控制存在缺陷，从而为管理层盈余管理提供机会，最终使企业走向坟墓。我国学者也对内部控制与盈余管理的关系进行了探索性的研究，得出了两种不同的结论:一种认为内部控制降低了公司的盈余管理程度，进一步的完善企业的内部控制，可以使财务信息更加真实可靠，企业内部控制设计的完整性合理和执行的有效性在很大程度上抑制了企业进行盈余管理；另一种观点认为内部控制设计与执行是否有效与盈余管理程度不存在任何关系。本文对我国上市公司内部控制与盈余管理进行实证分析。选取的样本为广东省，上海市A股2011年非金融上市公司为研究对象。样本量为403家，分为两部分，可以对比分析内部控制质量对盈余管理的影响。通过进行样本的描述性分析：经过内部控制审计的公司67家平均的盈余管理程度较低与未经过审计338家的上市公司，而403家公司都对外披露了内部控制评价报告。其次，通过多元回归实证分析：假设：内部控制质量与盈余管理负相关，并且内部控制经过审计的公司盈余管理程度较低。采用的计量模型为扩展的JONES模型，该模型更能从横截面较好的解释盈余管理的程度。通过计算出的操纵性盈余，建立与内部控制变量之间的相互关系。内部控制的量化指标包括：控制环境，风险评估，监督，信息与沟通，控制活动及公司规模。本文设定的显著性水平为0.05.最后，得出了实证分析的相关结论。因此对加强企业的长远发展，完善公司的内部控制，减少企业对盈余的管理提出相应的措施。我国内部控制审计是逐步实施的过程，对内部控制审计的热情不高，监管部门应加大监督力度并积极改善相关的法律法规，鼓励上市公司内部控制审计；完善企业的内部控制环境；加强监督，是独立董事职业化，并且其权利和义务制度化；增强信息系统与沟通，使信息链条畅通，促进内部控制有效实施。