随着荧光分析技术在生命科学领域的应用,各种能够特异性标记生物分子的荧光探针被越来越多的开发出来。吲哚菁染料作为其中的重要成员,具有吸收波长可调、量子产率较高、可修饰性强以及稳定性较好等优点。本文选取五甲川吲哚菁染料为母体,分别合成出羧基与硼酸基团修饰的近红外荧光染料,选用不同的纯化方法进行纯化得到较纯的荧光染料,最后对羧基修饰的染料的应用进行了初步探索。论文第一章首先综述了吲哚菁染料在生物分析、光盘存储、感光材料以及太阳能电池等领域的应用进展,然后分别综述了三甲川、五甲川以及七甲川吲哚菁染料的合成进展,从而确定了论文选题的目的及意义。论文第二章介绍了羧基修饰的荧光染料Dyel的合成路线及方法,选用IR、UV、荧光等方法对中间体及Dyel进行了表征,并且合成了两种结构相似的对称性的荧光染料Dye2和Dye3。论文第三章针对染料不同的电荷特性,创造性地使用DEAE-52离子交换色谱对染料进行纯化。首先对纯度较高的对称染料Dye2和Dye3进行预分离,证实了构思的可行性；然后对目标染料Dyel进行分离,与常规硅胶柱色谱比较,分离结果良好可行。论文第四章分别以Dyel和市售的商品化染料CFTM647SE对小鼠单克隆CRP抗体进行标记,两者标记度接近,证实了染料的实用性。论文第五章对自行设计的一种含有硼酸基团的染料进行了合成,相同结构未见文献报道,属首次合成。采用葡聚糖凝胶色谱G-25分别对非对称型染料Dye4和对称型染料Dye5进行了纯化,并用1H NMR对结构进行了表征。