网箱养殖过程中未被生物摄食的饵料、养殖生物产生的排泄物及代谢活动将对海底沉积环境产生一系列直接或间接影响。大量沉积物积聚海底会造成溶解氧含量降低、硫化物含量增加、引起水体富营养化，进而导致底栖微生物群落发生变化。本文分3个方面研究了象山港南沙岛网箱养殖区沉积物微生物群落多样性及其时空分布规律。1）沿距离网箱养殖区中心设置站位，研究了距网箱中心区不同距离站位表层沉积物微生物多样性的空间分布规律；2）研究了不同季节网箱养殖中心区微生物群落多样性的分布规律；3）研究了养殖区表层沉积物硫酸盐还原菌的时空分布规律。本研究的目的是：探讨网箱养殖区及其邻近海域微生物群落结构的时空变化规律，分析不同养殖区和季节文库间的组成及变化情况，摸清南沙岛网箱养殖区及邻近海域微生物多样性特征；揭示网箱养殖区微生物群落多样性及其影响因素，探讨微生物作为网箱养殖区生物修复指示种的可行性。主要研究结果如下：（1）通过构建16s rDNA克隆文库分析了南沙岛网箱养殖区及周边海域微生物多样性，获得了360个阳性克隆，借助DOTUR软件得到184个OTU，分为6个门：Gamma变形杆菌、硬壁菌门、 Beta变形杆菌、酸杆菌门、Delta变形杆菌、拟杆菌门，4个次要的微生物类群：Alpha变形杆菌，放线菌门，绿弯菌门，Epsilon变形杆菌。 Epsilon变形杆菌只出现在网箱养殖区中。Gamma变形杆菌所占的百分比从1号站位到4号站位沿递减， Beta变形杆菌，放线菌门所占的百分比从1号站位到4号站位沿递增。分析了微生物多样性和主演沉积物环境因子之间的相关关系。（2）构建了网箱养殖中心区不同季节的16s rDNA克隆文库。获得了360个阳性克隆，借助DOTUR软件得到214个OTU，分为6个细菌门：包括Gamma变形杆菌，Alpha变形杆菌，Delta变形杆菌，拟杆菌门Bacteroidetes，硬壁菌门Firmicutes，放线菌Actinobacteria。同时也检测到酸杆菌门Acidobacteria，绿弯菌门Chloroflexi，硝化螺旋菌门Nitrospirae，Epsilon变形杆菌，梭杆菌门Fusobacteria，真核生物Eukaryota，热脱硫杆菌门Thermodesulfobacteria等微生物。利用∫-Libshuff软件对克隆文库进行文库间差异分析，分析得到的P值均小于0.05（P<0.05），表明各个文库在群落组成上存在显著差异，说明群落结构在不同季节有较显著的变化。分析了季节变化微生物多样性和主要沉积物环境因子之间的相关关系。（3）硫酸盐还原菌（SRB）是海洋沉积物中一系列生化进程的重要调节器，它能调节有机物质代谢，污染物的生化降解和硫循环和碳循环。本文通过构建硫酸盐还原菌dsrAB基因的克隆文库研究了象山港南沙岛网箱养殖区表层沉积物硫酸盐还原菌的时空分布。网箱养殖区中心站位SRB的多样性最高，不同克隆文库间的比较得出4个克隆文库差异显著。硫酸盐还原菌多样性跟氧化还原电位、可挥发硫酸盐和硫化物的含量等环境因子有关。