几种自噬基因多态性与ANCA相关性血管炎关系的研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:z534921
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分ATG5基因多态性与ANCA相关性血管炎关系的研究研究目的:ATG5基因单核苷酸多态性在原发性中性粒细胞胞浆抗体(ANCA)相关性血管炎(AAV)中的意义尚缺乏研究,本研究旨在探讨ATG5基因10个位点在广西汉族和壮族人群中与ANCA相关性血管炎的关系。研究方法:收集广西汉族和壮族人群中符合AAV入组标准的177例患者(AAV组)和216例年龄、性别相匹配的健康人(对照组)为研究对象,对照组包括汉族158例,壮族58例;AAV组包括汉族115例,壮族62例,收集研究对象临床资料,采集全血提取DNA。采用多重聚合酶链式反应结合高通量测序法对选定的SNP进行基因分型检测。分别对汉族和壮族人群采取病例-对照研究,分析各SNP基因型与等位基因及其构成的常见单体型在对照组及AAV组的分布差异。结果:(1)纳入研究的ATG5基因10个SNP位点分别是rs617994、rs1766193、rs656994、rs148316514、rs573775、rs662114、rs510432、rs506027、rs3761796、rs473543,所有SNP的等位基因在广西汉族和壮人群中均检出,且频率>0.01。(2)ATG5基因10个SNP位点在广西汉族和壮族人群中,对照组与AAV组的基因型频率和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。(3)广西汉族和壮族人群中,ATG5基因10个SNP位点共构成的6个常见单体型。在广西汉族人群中,单体型VI相较于单体型I具有更低的AAV发病风险(OR=0.24,95%CI=0.07-0.84,P=0.027)。结论:(1)ATG5基因rs617994、rs1766193、rs656994、rs14831654、rs573775、rs662114、rs510432、rs506027、rs3761796、rs473543在广西汉族和壮族人群中存在多态性,但可能与广西壮族人群AAV的遗传易感性无关。(2)广西汉族人群中,单体型rs617994G-rs1766193T-rs656994T-rs14831654Crs573775A-rs662114G-rs510432C-rs506027A-rs3761796A-rs473543G可能对AAV存在影响。第二部分ATG16L1基因多态性与ANCA相关性血管炎关系的研究研究目的:本研究旨在探讨ATG16L1基因10个位点单核苷酸多态性在广西汉族和壮族人群中与ANCA相关性血管炎的关系。研究方法:采用多重聚合酶链式反应结合高通量测序法对选定的SNP进行基因分型检测,在273例汉族人群与120例壮族人群中行病例-对照研究。结果:(1)纳入研究的ATG16L1基因10个SNP位点分别是rs10210302、rs6737398、rs2241880、rs3792109、rs2241877、rs3792106、rs4663396、rs4663402、rs4663421、rs76072155,所有SNP的等位基因在广西汉族和壮人群中均检出,且频率>0.01。(2)ATG16L1基因10个SNP位点在广西汉族和壮族人群中,对照组与AAV组的基因型频率和等位基因频率差异无统计学意义。(3)rs10210302、rs6737398、rs2241880、rs3792109、rs2241877在汉族人群和壮族人群均为强连锁不平衡位点,构成4种常见单体型,但未发现与AAV存在关联的单体型。结论:(1)ATG16L1基因rs10210302、rs6737398、rs2241880、rs3792109、rs2241877、rs3792106、rs4663396、rs4663402、rs4663421、rs76072155在广西汉族人群和壮族人群中存在多态性。(2)rs10210302、rs6737398、rs2241880、rs3792109、rs2241877、rs3792106、rs4663396、rs4663402、rs4663421、rs76072155可能与广西汉族人群和壮族人群AAV遗传易感性无关联。第三部分IRGM基因多态性与ANCA相关性血管炎关系的研究及其基因型与基因表达关系的研究研究目的:本研究旨在探讨IRGM基因5个位点单核苷酸多态性在广西汉族和壮族人群中与ANCA相关性血管炎的关系,并初步研究基因型与IRGM表达的关系。研究方法:采用多重聚合酶链式反应结合高通量测序法对选定的SNP进行基因分型检测,在273例汉族人群与120例壮族人群中行病例-对照研究。使用GTEx数据库初步探索与发病风险相关的SNP其基因型与基因表达间的关系,在广西壮族人群AAV患者样本中,采用实时荧光定量PCR方法,验证此种关系。结果:(1)纳入研究的IRGM基因5个SNP位点分别是rs13361189、rs72553867、rs10065172、rs1000113、rs11743488,在广西汉族和壮人群中多态性均存在,但rs13361189、rs10065172、rs1000113、rs11743488在纳入研究的广西汉族人群中未符合Hardy-Weinburg平衡,未行下一步分析。(2)广西壮族人群中,rs13361189、rs10065172、rs1000113、rs11743488在对照组与AAV组的基因型频率和等位基因频率差异有统计学意义(均P<0.05)。经Codominant、Dominant、Recessive、Overdominant、Log-additive遗传模型进一步分析显示,rs13361189CC基因型较T等位基因有更低的发病风险(OR=0.39,95%CI=0.15-0.99,P=0.043),C等位基因较T等位基因有更低的发病风险(OR=0.50,95%CI=0.29-0.86,P=0.010)。rs10065172TT基因型较C等位基因有更低的发病风险OR=0.39,95%CI=0.15-0.99,P=0.043),C等位基因较T等位基因有更低的发病风险(OR=0.50,95%CI=0.29-0.86,P=0.010)。rs1000113TT基因型相较于C等位基因,有较低的发病风险(OR=0.36,95%CI=0.14-0.91,P=0.026),T等位基因较C等位基因发病风险较低(OR=0.51,95%CI=0.30-0.87,P=0.011)。rs11743488GG基因型相较于A等位基因,有较低的发病风险(OR=0.28,95%CI=0.10-0.78,P=0.010),G等位基因较A等位基因发病风险较低(OR=0.46,95%CI=0.26-0.80,P=0.004)。(3)广西壮族人群中,rs13361189、rs10065172、rs1000113、rs11743488呈现强连锁不平衡,rs13361189与rs10065172间呈现完全连锁不平衡,共构成4种常见的单体型,总体上单体型与AAV的发病风险差异有学意义(P=0.023),单体型II较最为常见的单体型I发病风险较低(OR=0.47,95%CI=0.27-0.82,P=0.009)。(4)利用GTEx数据库数据行e QTL分析及荧光定量PCR验证实验结果显示,rs13361189与rs10065172基因型间IRGM表达量间存在差异(均P<0.01)。结论:(1)广西汉族和壮族人群中rs13361189、rs72553867、rs10065172、rs1000113、rs11743488存在多态性。(2)广西壮族人群中,rs13361189、rs10065172、rs1000113、rs11743488及其构成的单体型可能与AAV的发病风险存在关联。(3)广西壮族人群AAV患者外周血中性粒细胞rs13361189与rs10065172各基因型间IRGM表达量存在表达差异。
其他文献
目的:探讨原发性肾病综合征患者住院期间并发急性肾损伤的相关危险因素,构建并验证原发性肾病综合征患者住院期间并发急性肾损伤的风险模型列线图。方法:回顾性研究2014年1月到2019年12月在广西医科大学第一附属医院肾内科住院的原发性肾病综合征病例189例。收集所有患者的人口学资料、入院首次检验结果、既往病史、用药史等。我们使用多因素逻辑回归模型确定原发性肾病综合征患者住院期间并发急性肾损伤独立危险因
目的:对比检测结直肠癌原发灶、淋巴结转移灶、肝转移灶和卵巢转移灶中CEA的表达情况,分析CEA在结直肠癌原发灶、肝转移灶、淋巴结转移灶和卵巢转移灶之间的表达差异及其意义。方法:回顾性的收集自2014年1月到2019年12月期间于广西医科大学附属肿瘤医院治疗和确诊的共45例晚期结直肠癌患者,45例患者中收到原发灶标本共40份(其中合并肝转移的结直肠癌患者原发灶24份,合并卵巢转移的结直肠癌患者原发灶
1热休克蛋白70的表达与宫颈癌临床病理特征及人乳头瘤病毒感染的Meta分析目的:采用Meta分析方法评价热休克蛋白70(Heat shock protein 70,Hsp70)在宫颈癌诊治中的临床意义。方法:计算机检索Pub Med、Cochrane Library、Web of Science、EMBASE、CBM、CNKI、万方和维普等数据库,搜集国内外公开发表的关于宫颈癌中Hsp70表达及其
目的:探讨腹腔热灌注化疗治疗胃肠道来源腹膜转移癌的安全性。方法:回顾性分析2019年3月至2020年3月期间广西医科大附属肿瘤医院收治的41例胃肠道恶性肿瘤并腹膜转移的患者,其中男24例,女17例,平均年龄49.87±15.4岁。行腹腔热灌注化疗(Hyperthermic intraperitoneal chemotherapy,HIPEC)联合全身化疗者为A组,共19例;行单纯全身化疗者为B组,
目的分选出人体的treg细胞,检测并分析机械生长因子对于treg细胞数量上的影响和功能上基因FOXP3的表达。诱导强直性脊柱炎的大鼠模型,检测并分析机械生长因子对于大鼠组织病理学和炎症相关细胞因子的影响。方法磁珠分选正常男性的treg细胞,机械生长因子干预细胞后,采用CFSE法检测treg细胞增殖情况并且采用RT-PCR法检测treg细胞基因FOXP3表达。机械生长因子预防性治疗强直性脊柱炎大鼠模
研究背景及目的:肺癌是当今社会上最常见的恶性肿瘤之一,在常见的因疾病而死亡的原因中排名第一。我国作为一个经济发展中国家,由于人们的身体素质和生活质量不如发达国家,医疗水平和科学技术略显匮乏,因此肺癌发病率和死亡率的上升趋势尤为显著。新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)属于禽Ⅰ型副黏病毒科副黏病毒属,为单股负链RNA病毒。当禽类养殖业遭遇NDV的袭击时,若不幸发生大面
目的:喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)是头颈部最常见的恶性肿瘤之一,其生长部位虽局限,但易发生淋巴结转移。本研究探讨喉癌患者术前中性粒细胞/淋巴细胞比值(neutrophil-to-lymphocyte ratio,NLR)与淋巴结转移及预后的关系。方法:选取2008年01月~2017年12月广西医科大学附属肿瘤医院收治的102例喉癌患者
目的:回顾性分析95例原发性三叉神经痛(ITN)患者三叉神经的形态学指标,探讨其与原发性三叉神经痛的临床表现和经皮穿刺射频热凝术(PRT)预后的相关性。方法:收集2018年1月至2019年8月广西医科大学第二附属医院疼痛科收治并接受经皮穿刺射频热凝术治疗的95例ITN患者的临床病案资料及三叉神经MRI影像资料,获取ITN患者的年龄、性别、病变侧别、累及三叉神经分支、病程、疼痛NRS评分、既往史、血
目的:正常女性的阴道微生态环境处于动态平衡,当平衡被打破,会导致阴道内菌群紊乱,易出现细菌性阴道病(BV),也可能在一定程度上促进子宫颈鳞状上皮内病变(SIL)的发生,引起子宫颈癌。本文旨在评估BV与SIL的相关性。方法:使用计算机检索7个数据库,英文数据库包含:The Cochrane Library、Pub Med、Web of Science;中文数据库包含:中国知网、中国生物医学文献数据库
目的:探讨影响输卵管吻合术后妊娠的相关因素,提高术后妊娠率。方法:回顾性分析我院2012年10月-2018年1月99例输卵管结扎患者行输卵管吻合术持续备孕至少1年的妊娠情况。分析手术方式、术中通畅情况、年龄、体重指数、绝育时间、绝育部位、术后输卵管长度、输卵管评分与术后妊娠的关系。所有资料均采用SPSS 22.0软件进行数据分析。结果:(1)我院输卵管吻合术后妊娠率可达56.57%。(2)经腹显微