本实验以凉山半细毛羊为研究对象，选择了分布在基因组第1、第2、第3、第9条染色体上的36个微卫星标记，在实验过程中将36个位点分成17个位点、10个位点、9个位点共3组进行多重PCR，计算了凉山半细毛羊晶系群体在这36个微卫星标记座位上的等位基因频率，并作了卡方检验，微卫星的多态信息含量、群体杂合度、每个位点亲子关系排除概率、多个位点联合排除概率也进行了分析；利用这36个微卫星位点，建立了H1G4003家系的实验系谱，同时建立了7只公羊的半同胞家系。 实验结果表明，所选择的36个微卫星标记在所检测的群体中表现出良好的多态性，每个微卫星标记平均检测到8.8个等位基因，各个等位基因分布符合Hardy-Weinberg平衡；三组微卫星标记的平均杂合度为0.66297、0.72615、0.74166，平均多态信息含量为0.58412、0.46407、0.55636，亲子鉴定的排除概率为0.99999999、0.9999999、0.999999，9个位点亲子关系排除概率比已发表的稍微高一点。通过实验系谱与系谱纪录的比较，绝大部分的系谱纪录是正确的，其中98年的系谱纪录全部正确，说明了用所选的三套微卫星标记进行亲子鉴定结果比较可靠。在本实验中，还用亲子鉴定的排除方法建立了7只公羊的半同胞家系，纠正了系谱记录中出现的错误，为对凉山半细毛羊这个晶系群体进行一些生产性状的准确QTL估计分析提供了科学资料。