经过改革开放后接近三十年的不断发展,民营企业已经经历了从无到有、从小到大的发展过程,并形成越来越强的经济实力,在我国的国民经济宏观格局中占有着越来越重要的地位。但是随着新的一个世纪的到来,知识经济已然成为全球不可遏制的发展潮流,信息技术的突飞猛进,日新月异也使得经济发展的传统模式遭遇愈来愈严峻的挑战。我国的民营公司是在特定的历史条件下产生并逐步发展壮大的。由于产生和成长的特殊性,民营企业普遍采用家族式的管理模式,呈现出产权关系的模糊性、股权集中度高等诸多特点。这种产权制度和治理结构的特点在一定程度上适应了民营企业初创时期发展的需要,但随着企业规模的不断扩大和外部竞争的不断加强,其弊端开始显现,因此,要保持民营公司持续、稳定、快速的发展,必须对产权制度进行改革,完善其公司的法人治理结构。本文首先从分析民营企业的公司治理结构现状入手,结合民营企业公司治理结构的特点发现其中存在的问题,并将其公司治理结构问题归结为民营企业产权问题、委托代理问题和股份制民营企业董事会问题三个方面,然后本着发现问题、解决问题的精神对如何建立有效的民营公司治理结构进行探讨,具体从民营企业产权结构、董事会的建设、监事会制度以及民营企业的内部委托代理关系等方面进行完善,最后通过结合民营企业的实际案例,探索如何有效地建立该类企业治理结构以及提高企业运行效率和公司治理结构的整体效率等,为民营企业的改革工作提供一定的指导意见。最终从根本上解决民营企业发展中遇到的“瓶颈”问题,使其能够良好应对新世纪、新形势下所面临的机遇和挑战。