拷贝数缺失相关长非编码RNA-MIR99AHG抑制肺腺癌恶性进展的机制研究

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【目的】肺癌发病率与死亡率均位于所有恶性肿瘤之首,我国肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)发病率已远高于肺鳞癌(Lung Squamous Cell Carcinoma,LUSC),成为肺癌中最常见的病理亚型。近年来大量的研究结果发现长非编码RNA(long non-coding RNA)在肿瘤的发生及恶性进展中发挥关键的调控作用,本研究旨在探究lnc RNA-MIR99AHG在肺腺癌发生发展中的调控作用,为肿瘤的诊断与防治提供新靶点与新途径。【方法】本研究通过挖掘癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肺腺癌数据集中的转录组表达谱数据和拷贝数变异(Copy Number Variations,CNV)数据,筛选出一条在肺腺癌中差异表达且功能未知的lnc RNA-MIR99AHG。利用q RT-PCR在58对LAC临床样本及LAC细胞系中验证MIR99AHG的表达及其与临床特征的相关性,通过体内外功能研究MIR99AHG潜在的生物学功能。结合Western Blot、荧光定量PCR反应(RT-PCR)、RNA-蛋白Pull-Down实验(RNA-Protein Pull-Down)、RNA免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)、免疫染色、透射电镜等技术探讨MIR99AHG发挥生物学功能的分子机制。【结果】基于TCGA肺癌基因组大数据,对非小细胞肺癌CNV区域进行了分析,通过建立CNV、表达及预后的相关模型,筛选出一条在肺腺癌中表达下调且功能未知的lnc RNA-MIR99AHG。在58对LAC组织样本及细胞系中验证了MIR99AHG在癌组织中呈低表达,且其表达与TNM分期及淋巴结转移呈负相关。体外细胞功能学实验结果显示过表达MIR99AHG可以显著抑制LAC细胞的增殖、侵袭和迁移能力,敲降MIR99AHG后则结果相反。裸鼠尾静脉转移模型结果显示过表达MIR99AHG后小鼠肺内转移结节数显著减少。Western Blot实验检测自噬相关蛋白、自噬流及透射电子显微镜实验结果提示过表达MIR99AHG后可以促进LAC细胞自噬。荧光原位杂交实验(Fluorescence in situ hybirdization,FISH)、核质分离实验证实MIR99AHG主要分布于细胞质中。通过RNA-蛋白结合实验、质谱分析、RIP实验发现MIR99AHG可以绑定膜联蛋白A2(Annexin A2,ANXA2)而发挥作用。以ANXA2为拯救节点,用Western Blot实验,荧光染色实验等证实MIR99AHG可阻止ANXA2入核促进自噬泡形成。【结论】1、MIR99AHG在肺腺癌组织及细胞系中表达显著下调,其表达量与TNM分期及淋巴结转移显著负相关;体内外功能实验证实MIR99AHG在肺腺癌中起抑癌作用。2、MIR99AHG通过绑定并阻断膜联蛋白A2(Annexin A2,ANXA2)入核加强自噬泡形成,促进自噬抑制肺腺癌恶性进展。
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