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肝脏是机体物质代谢、能量转换和免疫调节的重要器官,生物学、化学致癌因素和遗传因素与肝脏肿瘤,如肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinomas,HCC)的发生发展相关。由于缺乏有效的早期诊断方法,HCC的五年生存率不足10%。虽然甲胎蛋白(alpha-fetoprotein,AFP)是目前临床上应用最为广泛的HCC诊断标志物,但是至少20-30%的HCC患者血清AFP水平不升高。因此,目前迫切需要寻找更为敏感和特异或能与AFP联用使用的HCC诊断标志。本研究对比分析不同AFP表达特性的肝癌和正常肝细胞系的蛋白质组成差异,鉴定到166个差异表达蛋白质,从中选择5个蛋白质进行深入的组织学和血清学验证,发现Annexin A2和TGM2(Tissue transglutaminase 2)有可能成为HCC潜在的候选标志分子。同时,参与了人类肝脏蛋白质组计划(Human liver proteomeproiect,HLPP)中健康肝标准和样本采集方法的制定、健康肝标本库的建立和表达谱数据的生物学意义解读等内容,发现表达谱数据充分反映了禁食状态下健康肝脏的生理和代谢特点,为深入研究疾病肝的蛋白质组改变提供了重要的参照数据。胰腺癌是恶性程度极高的实体瘤之一,由于起病隐匿,进展迅速,缺乏早期特异性症状和有效的治疗手段,五年生存率不足5%。目前常用的标志CA19-9灵敏度和特异度不高,诊断价值有限。为寻找新的胰腺癌血清标志,利用无血清器官培养方法,富集并浓缩了胰腺癌细胞分泌、释放到血液中的肿瘤相关蛋白,构建了胰腺癌相关的游离蛋白表达谱。分别在正常胰腺和胰腺导管腺癌中鉴定了150个和533个游离蛋白。生物信息学分析显示,分别有35%和43%的蛋白定位于细胞外和细胞膜,涉及细胞发育、免疫、应激反应等生物学过程,为认识胰腺癌生物学性质及其发生发展机制,发现新的胰腺癌相关标志分子提供重要参考。