肺炎链球菌自溶素LytA的结构和功能研究

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LytA存在于多种链球菌中,包括致病菌肺炎链球菌、假肺炎链球菌和轻型链球菌等。由于它在细菌自溶过程中发挥关键作用而得名自溶素。LytA是锚定在细菌细胞壁上的肽聚糖水解酶,能够水解N-乙酰胞壁酸和L-丙氨酸之间的酰胺键,但是其激活机制和发挥生理功能的分子机制仍然不清楚。我们解析了肺炎链球菌LytA的全长结构,分辨率为2.1A。LytA的全长结构为一个飞镖形状的同源二聚体,其相互作用区域位于C末端。每个亚基都包含有一个N端的酰胺酶结构域和一个C端的胆碱结合结构域,其中胆碱结合结构域有6个胆碱结合重复区,包括5个典型的和1个单层的胆碱结合位点。LytA N端的酰胺酶结构域上具有一个Y型的底物结合沟槽,结构分析结合生化实验证明其可能的底物为肺炎链球菌细胞壁的三个分支:糖链、肽链和磷壁酸。另外,点突变结合酶活实验表明二聚化和所有胆碱结合位点被胆碱分子完全占据,才能使LytA具有完全催化活性的构象,进而使其2个酰胺酶结构域维持合适的距离来切割肽聚糖上相距103A的2个乳酰-酰胺键。另外,我们还对肺炎链球菌中的肽聚糖水解酶CbpD进行了结构和功能研究。为了获得上清表达、稳定性好和状态均一的目的蛋白,我们尝试了CbpD的多个截短版本。虽然最终未能解析其结构,但我们的工作会为后续的研究奠定基础。同时,我们构建了多个肽聚糖水解酶基因的敲除株,发现LytA和LytC倾向于水解初生肽聚糖,并且敲除会影响细菌粘附宿主细胞。
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