水稻籼粳交DH群体抽穗期超亲现象的遗传解析

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本文以籼稻ZYQ8、粳稻JX17及其后代DH群体102个稳定株系为材料,利用8940个SLAF标记构建的高密度遗传图谱进行抽穗期QTL定位,并对抽穗期QTL区域内与已克隆抽穗期基因结构类似的基因进行序列分析。研究变异基因位点与抽穗期性状之间的关联性,确定控制抽穗期的候选基因,分析候选基因的基因效应。主要研究结果如下:1、DH群体的抽穗期变异十分广泛,抽穗期最短的株系比抽穗期短的亲本JX17短10天,抽穗期最长的株系比抽穗期长的亲本ZYQ8长19天,存在明显的超亲遗传现象。DH群体抽穗期的分布呈现双峰分布,表明控制水稻抽穗期的基因有主效基因。2、三次试验分别在1号、3号、6号、8号四条染色体上检测到了水稻抽穗期QTL位点。其中,两年都定位到了8号染色体上的QTL,LOD值都在6.0以上,变异贡献率为24.3%~27.7%,位于染色体3Mb~10Mb区域。3、采用生物信息学的方法在4个QTL区域内筛选出了9个与植物生育期基因结构类似的基因,其中已克隆鉴定的水稻抽穗期基因5个,未鉴定的基因4个。对JX17、ZYQ8及其DH群体的9个生育期结构类似基因进行序列分析,发现3号染色体上的Hd16以及8号染色体上的Hd18、Os HAP5F等3个基因存在非同义SNP位点,8号染色体中已克隆的生育期主效基因DTH8的DNA序列在亲本间没有差异。关联分析表明,3号染色体上已克隆的水稻生育期基因Hd16和8号染色体上功能尚未鉴定的Os HAP5F等两个基因与水稻抽穗期存在极显著的相关性(P值分别为0.002和0.0001)。4、Hd16基因效应为4.668天,Os HAP5F基因效应为-6.393天。DH群体中一个重组基因型抽穗期的平均值比生育期短的亲本基因型抽穗期的平均值短,另一个重组基因型抽穗期的平均值比生育期长的亲本基因型抽穗期的平均值长。来自亲本籼稻ZYQ8的Os HAP5F与亲本粳稻JX17的Hd16重组,可以让籼粳交后代抽穗期变短;而来自亲本籼稻ZYQ8的Hd16与来自亲本粳稻JX17的Os HAP5F重组,可以使籼粳交后代抽穗期变长。本文认为,Os HAP5F很可能是一个新的控制抽穗期的主效基因。这个基因可能编码一种信号分子,由特定的其他“信号”激活而分泌,作用于另一抽穗期相关基因转录启动子上,通过控制这种基因的表达水平,对水稻抽穗期进行调控。这有待实验进一步验证。
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