【摘 要】
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由转移-信使RNA(transfer-message RNA,tmRNA)和Small protein B(Smp B)介导的反式翻译广泛存在于细菌中。当细菌在翻译过程中由于m RNA缺陷而导致核糖体滞留时,反式翻译系统将释放停滞在缺陷m RNAs上的核糖体亚基,并标记新生多肽以将其水解。已有研究表明,除了行使反式翻译的功能外,tmRNA还可以作为s RNA,通过与靶m RNA进行不完全碱基配对,
【基金项目】
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国家自然科学基金面上项目,“维氏气单胞菌SmpB及AcrR蛋白介导持留菌耐药的分子机制”(编号31772887); 海南省自然科学基金青年基金项目,“维氏气单胞菌毒力因子的挖掘及侵染宿主机制的分析”(编号319QN161); 海南省自然科学基金项目,“维氏气单胞菌转移信使RNA调控致病关键蛋白的研究”(编号317015)
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由转移-信使RNA(transfer-message RNA,tmRNA)和Small protein B(Smp B)介导的反式翻译广泛存在于细菌中。当细菌在翻译过程中由于m RNA缺陷而导致核糖体滞留时,反式翻译系统将释放停滞在缺陷m RNAs上的核糖体亚基,并标记新生多肽以将其水解。已有研究表明,除了行使反式翻译的功能外,tmRNA还可以作为s RNA,通过与靶m RNA进行不完全碱基配对,在转录水平调节靶基因的表达。维氏气单胞菌(Aeromonas veronii)是一种条件致病菌,tmRNA的缺失会导致维氏气单胞菌有生长缺陷,对多种抗生素敏感,对罗非鱼的半致死浓度降低6~7倍,表明tmRNA对于维氏气单胞菌的致病性、耐药性和毒力等方面均具有重要调节作用。本研究证明tmRNA可以以反式翻译拯救和s RNA两种方式,在翻译水平和转录水平两个方面对反式翻译底物丙氨酸脱氢酶(alanine dehydrogenase,ALD,EC 1.4.1.1)进行双重调控,从而对细菌的氧化应激耐受性产生影响。一方面,tmRNA作为反式s RNA,通过与ald启动子区结合,负调控启动子活性,实现转录水平的调控。本研究首先通过转录组测序和RT-q PCR检测发现,维氏气单胞菌tmRNA缺失型与野生型相比,其ald m RNA的表达量在稳定期显著增加,但在对数生长期没有变化;通过构建ald启动子与绿色荧光报告基因egfp的融合载体p DH118,并与tmRNA表达载体共转化至E.coli Feldon中,证明tmRNA对ald启动子具有负调控作用;最后通过Inta RNA软件预测tmRNA与ald启动子的结合区域,并通过点突变验证两者的互作位点,结果显示tmRNA与ald启动子转录起始位点上游-143bp至-136bp区域通过碱基配对结合,从而影响ald基因的转录水平。另一方面,ALD蛋白被检测到是tmRNA介导的反式翻译的作用底物,在翻译过程中被标记和拯救,以保证翻译的顺利进行。本实验室前期通过蛋白质组学手段鉴定ALD蛋白为潜在的反式翻译底物。本研究通过构建ALD-GST融合表达载体和Western blot证明ALD蛋白经反式翻译拯救后形成截短体;并通过RNAfold软件预测标记位点附近m RNA的二级结构、结合免疫印迹实验和对关键位点的互补突变技术,证明标记位点后紧邻的茎环结构区域是发生核糖体阻滞的原因;由此提出核糖体滞留机制。表型鉴定实验证明tmRNA缺失型菌株比野生型菌株对于氧化应激具有更强的耐受性。本研究剖析tmRNA调控维氏气单胞菌氧化耐受性的作用机制,首次阐明tmRNA对ALD的双重调节功能,拓展了tmRNA的生物学功能,即可发挥反式翻译和s RNA两种作用,将tmRNA参与反式翻译系统的功能与其作为s RNA的功能整合统一,为深入研究病原菌的致病机制提供新的理论基础。
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