本文以区域水资源可持续利用为目标，以可利用水资源量为切入点，提出了沿海缺水区可利用水资源量的定义及计算方法，并对影响可利用水资源的三个主要因子：生态需水量、洪水弃水量及不可以利用水量进行了分析及确定；通过基于自产可利用水资源量及可利用水资源总量与需水进行的平衡分析，揭示了沿海缺水区如仅以自产水资源为依赖，其缺水的状况将非常严峻，并提出了建立在自产水资源与过境水资源综合利用及水功能区水质达标基础上的沿海缺水区水资源开发思路；针对沿海缺水区基于可利用水资源的水资源开发中面临的水质问题，包括水功能区水质达标、过境水水质达标控制及河口蓄淡水库的盐度影响等进行了分析：(1)在环境容量总量控制模式的思路上，通过合理计算区域各河道湖库的环境容量及对区域水平年的污染物排放进行预测等的基础上，对区域基于水功能区水质达标的减污控制进行了研究，给出了区域各水功能区水质达标前提下的减污控制量，为区域水资源可持续利用提供了水质控制的依据。(2)提出了考虑跨行政区界面河流特征、河流水量水质状况及污染物排放等的跨行政区界面水质达标控制模式，并以跨行政区的九洲江流域进行了实例研究，计算给出了跨省界断面上游各河段的污染物排放控制值和跨行政区界面河段的环境容量；并对河道型水库的水质达标控制进行研究，提出相应的控制模式。(3)通过室内模拟换水实验，研究了河口水库底泥盐度特征及计算了底泥盐度的释放通量，底泥盐度释放特征主要表现为换水初期较快，然后随时间的推移逐步变缓，底泥盐度释放主要受底泥间隙水本底盐度及换水周期影响；在实验成果的基础上，建立了考虑来水状况及底泥间隙水本底盐度的河口蓄淡水库盐度达标预测数学模型，并以鉴江河口蓄淡水库为例进行了淡化时间预测。通过本文所提水资源开发模式的指引，并解决水资源开发中面临的水质的问题，可以实现沿海缺水区水资源的可持续利用。