辣椒炭疽病是辣椒生产上的重要病害,严重制约辣椒生产。从湖南长沙、常德、怀化、岳阳、株洲、衡阳、郴州等地采集疑似辣椒炭疽病样品,分离纯化获得73株菌株,结合菌株形态学特征和rDNA ITS序列克隆与分析,并通过柯赫氏法则验证,明确了引起湖南省辣椒上炭疽病发生的病原菌有Colletotrichum gloeosporioides、C. acutatum、C. truncatum、C. brevisporum4种。结合部分肌动蛋白(ACT)、p-微管蛋白(TUB2)、钙调蛋白(CAL)、谷氨酰胺合成酶(GS)、三磷酸脱氢酶(GPDH)5个基因的克隆与分析,利用邻接法(MEGA 5.0)构建系统进化树,揭示了湖南省辣椒炭疽病菌群体种间和种内遗传分化信息。聚类分析表明,湖南省辣椒炭疽病菌遗传变异与地理结构和寄主植物存在一定的相关性。同时,病原菌的遗传分化也影响着菌株本身的形态学特征、致病性和对化学杀菌剂的抗性等生物学性状。利用菌丝生长速率法测定4种不同辣椒炭疽病菌对唑菌酯的敏感性,并对其作用靶标基因细胞色素b基因(Cytb)序列进行比较分析。结果表明：C. brevisporum YYGXZ07, C. truncatum CZHP03, C. acutatum HHBY48和C. gloeosporioides CSLL11对唑菌酯的ECso范围分别为0.098 μg/mL,3.363μg/mL、10.156μg/mL和31.982μg/mL,而且供试菌株在含药培养基上的生长速率序为C. truncatum CZHP03<C. brevisporum YYGXZ07<C. acutatum HHBY48< C. gloeosporioides CSLL11;不同菌株的作用靶标基因Cytb氨基酸比对分析发现C. acutatum HHBY48、C. truncatum CZHP03和C. brevisporum YYGXZ07与C. gloeosporioides CSLL11的Cytb氨基酸序列同源性分别为82.98%、88.30%和87.77%,推测6个氨基酸位点可能与菌株对唑菌酯的敏感性存在关联。