随着经济的快速发展，企业之间的竞争已发展成为供应链之间的竞争。农产品作为人们生活的必需品，关乎国计民生。以市场为导向的农产品供应链体系可以增强我国农产品市场竞争力，增加农产品在流通过程的价值，对我国农业的发展有着至关重要的作用。鲜活农产品供应链是基于一类易腐，时鲜性较强的特殊变质产品所形成的供应链，极容易受到内外部的各种环境的影响，如自然灾害、需求突变等。近年来，突发事件的频繁发生对我国农业发展及社会稳定造成了极大的影响。当突发事件影响到企业的生产经营或市场需求时，如何快速反应，做出合理决策以减少扰动带来的损失是一个具有现实意义的问题。本文主要研究了鲜活农产品三级供应链如何应对突发事件的双因素的扰动。首先，本文研究了需求函数为d=ap^-kθ，由单生产商、单分销商和单零售商组成的鲜活农产品三级供应链在市场规模和产品成本同时扰动时的供应链最优应对策略，根据扰动的程度不同，分别在集中决策和分散决策两种情况下提出各自的协调策略，其中在分散决策下，本文采用了收益共享契约，验证了改进后的收益共享契约可以实现受到冲击的供应链协调。之后，本文研究了市场规模和产品成本这两个因素在先后不同时期的扰动下鲜活农产品三级供应链的协调策略，提出了集中决策下调整鲜活农产品最优订购数量和零售价的最优应急策略。研究表明：对于市场规模扰动的每一种子情形，在对应的产品成本扰动阶段也都具有相应的鲁棒性，一定区域内供应链的最优鲜活农产品订货量和零售价格均可保持不变。