小企业的制度包括小企业的产权制度、财产组织制度、管理制度等。这些制度的选择是影响小企业制度效率的基本性因素。有效的外部制度环境是影响小企业制度效率的另一重要因素。 在产权制度上，小企业应该选择产权界区比较清晰的私营小企业；在组织形式上，小企业应该侧重发展个人独资企业和合伙企业，而不是大量注册为公司制企业，形成对有限责任的滥用；在管理制度上，所有权与经营权合一的古典企业制度(家族管理)仍是小企业有效的管理模式，但是，其具体的经营管理方式必须不断创新。 政府应为小企业的发展和小企业制度效率的发挥，提供公平有效的竞争环境。政府的制度支持旨在降低小企业的交易成本，而不是通过抑制大企业的发展，引导社会资源流向小企业，促进小企业的发展。政府的扶持措施必须通过经济的和法律的手段。必须减少政府对资源配置的行政干预，防止政府的机会主义行为所导致的较高的制度运行成本，这也是我国小企业发展的最大的外部环境障碍。