科学技术是第一生产力。伴随着我国社会主义市场经济体制建设的深入推进,提高科学水平成为推动我国经济持续快速健康发展的重要力量。2005年,我国出台了《国家中长期科学和技术发展规划纲要》,正式将提升科技水平列入国家级战略,大力加强了科研经费投入力度。但随着科研经费的逐年提高,经费使用的违法违规活动也日益增多,已严重影响到我国科研项目的健康发展,强化科研项目审计力度势在必行。论文通过探究我国科研项目审计的发展历史和现状,结合科研项目审计的实际情况,分别从科研项目管理、科研项目的课题制及审计本身三个方面对科研项目管理和审计存在的问题进行了阐述和深入分析,通过借鉴国外的先进经验,探索适合我国科研项目管理和审计的制度及方法,以期有助于完善科研项目法律、法规的体系建设,规范科研项目管理,减少科研项目负责人在科研经费上的违法违规行为,为今后科研项目的管理与审计提供借鉴。本文通过分析与科研项目相关的法律、法规,调研科研项目审计的实际情况,发现现行的科研项目在管理中仍然存在法规和制度不健全、科研项目预算设置不科学以及政府主导型的多头管理制度致使科研项目重复立项等问题。同时,科研项目课题负责人的权限过大,缺乏监督制约机制,也加大了审计的难度。在审计制度方面,目前,审计部门在行政地位L缺乏足够的独立性,审计的行政职能偏差,审计工作方式相对落后,这些都不利于对科研项目的监督和监管。究其原因,科研项目经费曾经严重短缺导致客观上忽略了科研经费的违法违纪行为,另外,单位对审计工作的长期忽视,也是主观上造成目前审计现状的重要因素。通过借鉴美国、德国、日本等国家在科研项目管理审计中的相关经验,结合实际情况,本文分析了科研项目管理审计中存在的问题,对改进科研项目审计提出了一些建议。如,在科研项目管理中引入目标管理,在科研项目的立项、实施和评价验收三个阶段,根据不同阶段的不同目的,使用不同的项目管理方法,以期能更好地对科研项目进行管理,实现其既定目标。除此以外,还建议通过引入拟成果购买制,界定课题等级评价制度和课题分级奖励制度等新思路来提高对科研项目的管理水平,完善审计手段。